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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001571`

染色体: Chr05 坐标: 14376009-14377505 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001571`
名称	SmilChr05G001571
描述	ethylene-responsive transcription factor 3-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	14376009 - 14377505 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986255`
GeneID	`130986255`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986255`
原始查询	`SmilChr05G001571`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ethylene-responsive transcription factor 3-like
产物	ethylene-responsive transcription factor 3-like
Arabidopsis	`AT1G50640` (ERF3) ethylene responsive element binding factor 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841486] identity=55.3; qcov=1.02; evalue=2.29e-52; confidence=high
Rice	`Os05g0497200` (ERF130) - identity=37.8; qcov=0.797; evalue=3.26e-26; confidence=medium
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF00847 (AP2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986255

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057765592.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765592.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765592.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057765592.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057765592.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:14376402`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B101,B75
`Chr5:14376570`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49
`Chr5:14376621`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C9
`Chr5:14376725`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	12	B122,B140,B2,B26,B43,B44,B65,B73,B97,C66,D7,D8
`Chr5:14376751`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,B135,C35,D3,D9
`Chr5:14376767`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	18	A1,B101,B11,B111,B126,B135,B63,B68,B86,C10,C15,C3,C35,C58,C76,C87,D3,D9
`Chr5:14376798`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B103,C61,C9,D4,D5
`Chr5:14376830`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B111,B88,B90,C15
`Chr5:14376855`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B113,C15,C7,C86,D5
`Chr5:14376864`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B50,C3
`Chr5:14376865`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B4,C26,C72,D7
`Chr5:14376873`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	7	A8,B11,B124,B131,B134,C54,C55

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765592.1

232 aa

116

232

AP2

PF00847 AP2 29-78 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765592.1`	Pfam	`PF00847`	AP2	Domain	29	78	1.5e-13	51.5	AP2 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909609.1
GAAATTTGATCACCATTAAATGAAAGAGGCTCAGAGTGGGAGGGGCTCTCCTGTCATTTCCCCCTTTCCTAAATCTCCATAAAAGCAAGCGCAAATCTATGGGTTCAAGGTACGTAGTCGGTTTGTGGGGGGCGTCTGAGAAATCGAGAAACCAATTCACCCAAAAATCCCACAGACTAAAATATAAAATGAAAAATAAAAATAAAAATTAATTAAAAAAAAATAACGCCCCCCACCCCCATCCCCCCTTTTCTTTTTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986255
ATGCGGCGCGGCAGAGCGGCGGCGAGGCAAGCGGAGGCGATTCACGGCGGCGAAGTCAACGGATCTGGTGTTTCTAAGGAGGTCAGATTCCGTGGCGTCAGGAAGAGGCCATGGGGCCGTTTCGCGGCGGAGATCAGAGACCCGTGGAAGAAGACGCGCGTCTGGCTCGGCACCTTTGACTCGGCGGAGGACGCCGCCCGCGCCTACGACACCGCCGCTCGCTCGCTCCGCGGCTCTAAGGCCAAGACCAACTTTCCCGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765592.1
MRRGRAAARQAEAIHGGEVNGSGVSKEVRFRGVRKRPWGRFAAEIRDPWKKTRVWLGTFDSAEDAARAYDTAARSLRGSKAKTNFPVPLNGAVSPNFNPQNPNQPQIDDNPNDPFMDSRFYPQEHHIIAQQRPTSSGMSSTVESFSGPRQLPLPQPFVRQPRRYPRSPPMVPDDCRSDCDSSSSVVDDTECDIASSSCKKPLPFDLNMPPPVDAVAGVDADVDELACTALRL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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