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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001574`

染色体: Chr05 坐标: 14405143-14405820 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001574`
名称	SmilChr05G001574
描述	uncharacterized SmilChr05G001574
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	14405143 - 14405820 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025551`
GeneID	`131025551`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025551`
原始查询	`SmilChr05G001574`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os04g0204200; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os04g0204200; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G43760` (AT1G43760) DNAse I-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840968] identity=25; qcov=0.658; evalue=1.22e-08; confidence=low
Rice	`Os04g0204200` - identity=32; qcov=0.764; evalue=4.07e-14; confidence=low
GO	GO:0003824 (catalytic activity)
KEGG	-
Pfam	PF03372 (Exo_endo_phos); PF14529 (Exo_endo_phos_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025551

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057811329.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057811329.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057811329.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811329.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811329.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:14405239`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B126,B20
`Chr5:14405290`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A6,B70,C40,C55,C75
`Chr5:14405304`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	22	B102,B109,B119,B128,B136,B138,B16,B25,B28,B59,B61,B63,B70,B88,C17,C27,C30,C35,C38,C50,C70,D8
`Chr5:14405323`	`G`	`GTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	B23,C14,C61,C8
`Chr5:14405323`	`G`	`GTA`	2bp_insertion	CDS_variant	4	B23,C14,C61,C8
`Chr5:14405438`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C14
`Chr5:14405438`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C14
`Chr5:14405451`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B118
`Chr5:14405461`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C14,D11
`Chr5:14405477`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A9,C27,C78
`Chr5:14405490`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	65	A15,A22,A24,A5,A6,A7,A9,B1,B105,B107,B109,B11,B111,B118,B13,B132,B135,B136,B137,B139,B14,B23,B24,B27,B28,B33,B35,B38,B39,B5,B57,B59,B61,B65,B66,B67,B68,B74,B77,B82,B84,B91,B96,C14,C18,C2,C21,C32,C39,C4,C40,C45,C5,C54,C55,C58,C62,C68,C71,C74,C75,C78,C8,C80,C84
`Chr5:14405506`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811329.1

225 aa

112

225

Exo_endo_phos

Exo_endo_phos_2

PF03372 Exo_endo_phos 24-189 aa PF14529 Exo_endo_phos_2 67-192 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811329.1`	Pfam	`PF03372`	Exo_endo_phos	Domain	24	189	1.8e-06	28.6	Endonuclease/Exonuclease/phosphatase family
`XP_057811329.1`	Pfam	`PF14529`	Exo_endo_phos_2	Domain	67	192	1.5e-08	35.2	Endonuclease-reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955346.1
ATGAATGAGTTCAATCCTTCGATCTGTAACTCTTGGTGGGGAAAAGATTATTTTGGCTTTGCTGTTAGAAACTCTGAAGGAAGGTCAGGTGGTTTGGTCTGTGCGTGGAATGAGGAGGTTTTCCAAGTTTCCAGCAAGTGGGAGATCAATGGGGCGGTTATCGTGAATGGAAAGTGGATTAAAGAAGATATTGGGTGTTGTTTGATCAATGTTTACGCACCTGCTGGTGCCGGGGAGAAAGCTATTCTCTGGGATCTTAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025551
ATGAATGAGTTCAATCCTTCGATCTGTAACTCTTGGTGGGGAAAAGATTATTTTGGCTTTGCTGTTAGAAACTCTGAAGGAAGGTCAGGTGGTTTGGTCTGTGCGTGGAATGAGGAGGTTTTCCAAGTTTCCAGCAAGTGGGAGATCAATGGGGCGGTTATCGTGAATGGAAAGTGGATTAAAGAAGATATTGGGTGTTGTTTGATCAATGTTTACGCACCTGCTGGTGCCGGGGAGAAAGCTATTCTCTGGGATCTTAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811329.1
MNEFNPSICNSWWGKDYFGFAVRNSEGRSGGLVCAWNEEVFQVSSKWEINGAVIVNGKWIKEDIGCCLINVYAPAGAGEKAILWDLIKTIVEQNEDRCVCVMGDFNAVRKQEERAGEGDSFGAAEARNFDRFIRDSGLSEIRSQGRKFTWFKPNGKCKSKLDRFLVNESWLRQWEGTFGRGLQRTISDHCPILLMSKTEDWGPRPFRFLNVWMSHPEFEQKVKEV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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