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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001576`

染色体: Chr05 坐标: 14432793-14434284 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001576`
名称	SmilChr05G001576
描述	small ubiquitin-related modifier 1-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	14432793 - 14434284 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986259`
GeneID	`130986259`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986259`
原始查询	`SmilChr05G001576`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	small ubiquitin-related modifier 1-like
产物	small ubiquitin-related modifier 1-like
Arabidopsis	`AT5G55160` (SUMO2) small ubiquitin-like modifier 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835609] identity=89.4; qcov=0.959; evalue=1.39e-55; confidence=high
Rice	`Os01g0918200` - identity=81.8; qcov=1.01; evalue=2.41e-56; confidence=high
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0016925 (protein sumoylation); GO:0031386 (protein tag activity); GO:0044389 (ubiquitin-like protein ligase binding)
KEGG	-
Pfam	PF00240 (ubiquitin); PF11976 (Rad60-SLD)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986259

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057765594.1`
2	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057765595.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.80000	`XP_057765595.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057765594.1`
5	Nuclear body	核内小体	0.40000	`XP_057765595.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:14433835`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B52,B65,C29,C7
`Chr5:14433970`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	28	A13,A4,B100,B104,B108,B139,B25,B30,B59,B73,B8,B80,B9,B99,C11,C13,C21,C28,C31,C36,C48,C57,C63,C69,C74,C84,D11,D4
`Chr5:14434039`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A15,C3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765594.1

123 aa

123

Rad60-SLD

ubiquitin

PF11976 Rad60-SLD 20-77 aa PF00240 ubiquitin 22-77 aa

XP_057765595.1

98 aa

Rad60-SLD

ubiquitin

PF11976 Rad60-SLD 20-90 aa PF00240 ubiquitin 22-92 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765594.1`	Pfam	`PF11976`	Rad60-SLD	Family	20	77	3.9e-18	65.7	Ubiquitin-2 like Rad60 SUMO-like
`XP_057765594.1`	Pfam	`PF00240`	ubiquitin	Domain	22	77	6.5e-11	42.6	Ubiquitin family
`XP_057765595.1`	Pfam	`PF11976`	Rad60-SLD	Family	20	90	1e-25	90.0	Ubiquitin-2 like Rad60 SUMO-like
`XP_057765595.1`	Pfam	`PF00240`	ubiquitin	Domain	22	92	1.6e-16	60.5	Ubiquitin family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909612.1
GATAAATACGAATTTCCATCTAAAGTAGAATATGATACGTCAAGACCCACTCGAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAAAAGAATCGTATAAGACGCAATCCAGCCGTTGGATGCGAAGGAAGGCACATGAACCGTGGATGCAGTACTCTACGGAATTAAATATCCCCAACCAACCAAACCCCTCCGCCTCCCTCCGCCTCCTTAAAAAGCATAAAGGAAAGAAGTAATCAAACAATAAACAGGAGAGTGAGAATGTCGACTCCC...

XM_057909611.1
AAAAAAAAGAATCGTATAAGACGCAATCCAGCCGTTGGATGCGAAGGAAGGCACATGAACCGTGGATGCAGTACTCTACGGAATTAAATATCCCCAACCAACCAAACCCCTCCGCCTCCCTCCGCCTCCTTAAAAAGCATAAAGGAAAGAAGTAATCAAACAATAAACAGGAGAGTGAGAATGTCGACTCCCGGTACAGAGGAAGACAAGAAGCCTGGCGGTGATCAATCCGGACATATCAATCTCAAAGTCAAAGGCCA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130986259
ATGTCGACTCCCGGTACAGAGGAAGACAAGAAGCCTGGCGGTGATCAATCCGGACATATCAATCTCAAAGTCAAAGGCCAGGATGGAAATGAGGTCTTTTTCAGAATTAAAAGAAGCACCCAGCTGAAGAAACTAATGAATGCTTACTGTGATCGGCAATCAGTGGATCTCAGCTCCATTGCCTTTCTGTTTGATGGCCGTCGGCTCAGGGCAGAGCAGACTCCTGATGAGCTGGACATGGAGGATGGTGATGAGATAGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057765594.1
MSTPGTEEDKKPGGDQSGHINLKVKGQDGNEVFFRIKRSTQLKKLMNAYCDRQSVDLSSIAFLFDGRRLRAEQTPDEVFPPLIQFSFSFETHAHVDFCLSFNDLESHFESIFFCSWTWRMVMR

XP_057765595.1
MSTPGTEEDKKPGGDQSGHINLKVKGQDGNEVFFRIKRSTQLKKLMNAYCDRQSVDLSSIAFLFDGRRLRAEQTPDELDMEDGDEIDAMLHQTGGAFA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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