当前解析结果
SmilChr05G001605| 统一新 Gene ID | SmilChr05G001605 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G001605 |
| 描述 | protein SOB FIVE-LIKE 1-like |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 14795008 - 14796022 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130986287 |
|---|---|
| GeneID | 130986287 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130986287 |
| 原始查询 | SmilChr05G001605 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | protein SOB FIVE-LIKE 1-like |
| 产物 | protein SOB FIVE-LIKE 1-like |
| Arabidopsis | AT5G38790 (AT5G38790)uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833870] identity=41.7; qcov=0.567; evalue=2.34e-08; confidence=low |
| Rice | Os09g0473600- identity=39.5; qcov=0.598; evalue=1.57e-06; confidence=low |
| GO | GO:0009691 (cytokinin biosynthetic process) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF30936 (SOFL) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130986287 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 0.80000 | XP_057765635.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057765635.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.40000 | XP_057765635.1 |
| 4 | Cell membrane | 细胞膜 | 0.20000 | XP_057765635.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057765635.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057765635.1PF30936
SOFL 1-122 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057765635.1 |
Pfam | PF30936 |
SOFL | Family | 1 | 122 | 2.9e-22 | 80.3 | SOB FIVE-LIKE |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。