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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001608`

染色体: Chr05 坐标: 14818530-14820152 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001608`
名称	SmilChr05G001608
描述	peroxidase 11
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	14818530 - 14820152 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986289`
GeneID	`130986289`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986289`
原始查询	`SmilChr05G001608`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	peroxidase 11
产物	peroxidase 11
Arabidopsis	`AT1G68850` (AT1G68850) Peroxidase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843218] identity=66.4; qcov=0.895; evalue=5.33e-166; confidence=high
Rice	`Os06g0274800` (prx77) - identity=59.9; qcov=0.903; evalue=5.3e-141; confidence=high
GO	GO:0004601 (peroxidase activity); GO:0006979 (response to oxidative stress); GO:0020037 (heme binding); GO:0042744 (hydrogen peroxide catabolic process)
KEGG	smil00940 (Phenylpropanoid biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00141 (peroxidase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986289

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.80000	`XP_057765639.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.40000	`XP_057765639.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057765639.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765639.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765639.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:14818685`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B78,C23
`Chr5:14818794`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,A2,A7,C3
`Chr5:14818832`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A24,B21
`Chr5:14819102`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B71
`Chr5:14819151`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr5:14819610`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr5:14819719`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B128,B76,C53,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765639.1

362 aa

181

362

peroxidase

PF00141 peroxidase 72-324 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765639.1`	Pfam	`PF00141`	peroxidase	Domain	72	324	2.5e-77	260.6	Peroxidase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909656.1
CCAGACTGATAGTAGTTACATCCTCTCTTGACTAATACTTTTCACAAATTTTTACTCAAAAAAAATACAGCCATAGTTTGAATTCATGTGCCAAATCTCACTTATATAACTCATGCTCAAAAAGCTATTTCTACAATCTCTCTCTCTGAAACCATCCAAGAAAATCAGCTACTGCAAGCAAATGGCTGCTTCTCTTCACTCAAAAGGGCTCATTCTGCAACTGATCATATTGGCTCTTTGCATAGCCTTCTCCACCTTGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986289
ATGCTCAAAAAGCTATTTCTACAATCTCTCTCTCTGAAACCATCCAAGAAAATCAGCTACTGCAAGCAAATGGCTGCTTCTCTTCACTCAAAAGGGCTCATTCTGCAACTGATCATATTGGCTCTTTGCATAGCCTTCTCCACCTTGCACGCGAGTGAGCCGCCTCTAACCTTAGATTACTACAAATCCACGTGCCCCTCCGTGCTTGAAGTCGTCAGGAAAGAAATGGAATGCGCGGTGCTCTCTGATCCGCGCAATGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765639.1
MLKKLFLQSLSLKPSKKISYCKQMAASLHSKGLILQLIILALCIAFSTLHASEPPLTLDYYKSTCPSVLEVVRKEMECAVLSDPRNAALILRLHFHDCFVQGCDASVLLDDTITLKGEKKASNNIHALKGFRIIDRIKNRLESDCPATVSCADILTIAARDAVILVGGPYWHVPLGRKDSKTAGYALSDANLPTADDGLLSIIQKFIYQGLSVTDMVALSGAHTIGMARCVNFRDRIYGDFSSTAGTNSVSKSYLSKLKS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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