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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001610`

染色体: Chr05 坐标: 14826626-14827510 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001610`
名称	SmilChr05G001610
描述	E3 ubiquitin-protein ligase RSL1-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	14826626 - 14827510 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025558`
GeneID	`131025558`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025558`
原始查询	`SmilChr05G001610`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	E3 ubiquitin-protein ligase RSL1-like
产物	E3 ubiquitin-protein ligase RSL1-like
Arabidopsis	`AT5G60250` (AT5G60250) zinc finger (C3HC4-type RING finger) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836147] identity=54.4; qcov=0.836; evalue=1.22e-50; confidence=medium
Rice	`Os09g0420000` - identity=33.8; qcov=0.861; evalue=1.11e-21; confidence=low
GO	GO:0000151 (ubiquitin ligase complex); GO:0000209 (protein polyubiquitination); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006511 (ubiquitin-dependent protein catabolic process); GO:0008270 (zinc ion binding); GO:0031624 (ubiquitin conjugating enzyme binding); GO:0032436 (positive regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process); GO:0061630 (ubiquitin protein ligase activity)
KEGG	-
Pfam	PF01485 (IBR)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025558

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057811337.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057811337.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057811337.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811337.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811337.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:14826794`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B132,B42,C19
`Chr5:14826798`	`CAA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	5	A10,B62,B98,C79,D7
`Chr5:14826798`	`CAA`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	5	A10,B62,B98,C79,D7
`Chr5:14826984`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8
`Chr5:14827217`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B136,B45,B62,B77
`Chr5:14827217`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B136,B45,B62,B77
`Chr5:14827222`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811337.1

165 aa

165

IBR

PF01485 IBR 56-115 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811337.1`	Pfam	`PF01485`	IBR	Domain	56	115	6.9e-14	52.4	IBR domain, a half RING-finger domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955354.1
ATGGAATTGGAATTGGGGTGCAATTCAAATGAGTATATATCAGTCAAAAACTATTATGGACTTGAAGAAGAAACTTTTTATCTTGTAAGCAATTGCAGAACATTCTTGACGCCTAGGTTGTTAGAGATTCTGAGTCAGCGGCTGAAGGAGGCTTCGATTCCAGTGACAGAGAAAGTTTACTGCCCTTACCCGAAATGTTCAGCTCTAATGTCTATGGCAGAGGCTCTAGAACATTCAAAACCTGCCATAGTAGGAGCAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025558
ATGGAATTGGAATTGGGGTGCAATTCAAATGAGTATATATCAGTCAAAAACTATTATGGACTTGAAGAAGAAACTTTTTATCTTGTAAGCAATTGCAGAACATTCTTGACGCCTAGGTTGTTAGAGATTCTGAGTCAGCGGCTGAAGGAGGCTTCGATTCCAGTGACAGAGAAAGTTTACTGCCCTTACCCGAAATGTTCAGCTCTAATGTCTATGGCAGAGGCTCTAGAACATTCAAAACCTGCCATAGTAGGAGCAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811337.1
MELELGCNSNEYISVKNYYGLEEETFYLVSNCRTFLTPRLLEILSQRLKEASIPVTEKVYCPYPKCSALMSMAEALEHSKPAIVGAERSGARKCVKCNGHFCVKCKVPWHNNMTCIQYKTLNPHPPQEEAKLKNLAATNLWRQCVKCNHMIELAAGCYHMTCRYG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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