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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001614`

染色体: Chr05 坐标: 14914429-14917138 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001614`
名称	SmilChr05G001614
描述	S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	14914429 - 14917138 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986295`
GeneID	`130986295`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986295`
原始查询	`SmilChr05G001614`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme
产物	S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme
Arabidopsis	`AT3G25570` (AT3G25570) Adenosylmethionine decarboxylase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822144] identity=70.6; qcov=0.964; evalue=5.14e-176; confidence=high
Rice	`Os02g0611200` (SAMDC2) - identity=55.7; qcov=1.02; evalue=3.05e-133; confidence=high
GO	GO:0004014 (adenosylmethionine decarboxylase activity); GO:0005829 (cytosol); GO:0006597 (spermine biosynthetic process); GO:0008295 (spermidine biosynthetic process)
KEGG	smil00270 (Cysteine and methionine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00330 (Arginine and proline metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01536 (SAM_decarbox)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986295

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057765646.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057765646.1`
3	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057765646.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765646.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765646.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:14914721`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A1,A2,A7
`Chr5:14914819`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C12
`Chr5:14914836`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr5:14915024`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B103
`Chr5:14915051`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr5:14915122`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A1,A2,A7
`Chr5:14915314`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B69
`Chr5:14915314`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B69
`Chr5:14915316`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr5:14915373`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C53

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765646.1

360 aa

180

360

SAM_decarbox

PF01536 SAM_decarbox 9-333 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765646.1`	Pfam	`PF01536`	SAM_decarbox	Family	9	333	1.8e-113	379.8	Adenosylmethionine decarboxylase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909663.1
TGAGTGGCCAGGAATTATTCCCTAGCTCTATAAATATGCATCGTCATACAACAGCCAATGAAGAGATTTTGTCAAAGAAAACGATATCAGTTTGCAAAGGAAACACTTAAATTCTAGGGTTTCTTCTTCGGCGGCCGTTACAATAGTTTTTTCTGAATTGTACACAACGTGAATTGTGTTGCTTGAGACGATTGTTTACGCACAAAATTTAAACCTTTTGATTTAAGAGTAGATGATATAATGGAGACTAAAGGTGGGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986295
ATGGCTTTAACTGCCTCTGCAATAGGGTTTGAAGGTTTTGAAAAAAGGCTTGAAATCTCATTTTTTGAACCAAGCTTCTTTGCTGATCCTGAGGGTAAGGGACTCCGATCTCTTTCAAAATCCCAATTAGATGAAATCTTACAACCTGCTCAGTGCACCATAGTTGCTTCACTGTCAAATGAACATGTCGACTCGTATGTCCTCTCTGAGTCCAGCCTTTTTGTTTATCCCTATAAGATCATCATCAAAACCTGTGGGAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765646.1
MALTASAIGFEGFEKRLEISFFEPSFFADPEGKGLRSLSKSQLDEILQPAQCTIVASLSNEHVDSYVLSESSLFVYPYKIIIKTCGTTKLLLSIPPILKLAGLLSLSVQDVKYTRGSFIFPGAQSFPHRSFSEEVAVLDGYFGKLGSSGSKAYVMGSSDKRQQWHIYSASAGSVECDSPVYTLEMCMTGLDREKAAVFFKNESNVSMLMTNTSGIRNILPKSHICDFEFEPCGYSMNSIEGDAVSTIHITPEDGFSYASF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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