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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001639`

染色体: Chr05 坐标: 15351339-15356670 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001639`
名称	SmilChr05G001639
描述	nuclear matrix constituent protein 1-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	15351339 - 15356670 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986315`
GeneID	`130986315`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986315`
原始查询	`SmilChr05G001639`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nuclear matrix constituent protein 1-like
产物	nuclear matrix constituent protein 1-like
Arabidopsis	`AT1G67230` (LINC1) little nuclei1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843043] identity=39.3; qcov=0.968; evalue=0; confidence=medium
Rice	`Os01g0767000` (NMCP1B) - identity=29; qcov=0.685; evalue=1.32e-62; confidence=low
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0006997 (nucleus organization)
KEGG	-
Pfam	PF27881 (CRWN_N); PF30919 (CRWN_second_CC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986315

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057765676.1`
2	Cytoskeleton	细胞骨架	0.60000	`XP_057765676.1`
3	Phragmoplast	Phragmoplast	0.60000	`XP_057765676.1`
4	Spindle	Spindle	0.60000	`XP_057765676.1`
5	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057765676.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:15351849`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B38,B39
`Chr5:15351905`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,C68
`Chr5:15352245`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B106
`Chr5:15352542`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,C68
`Chr5:15352548`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B60,C9
`Chr5:15352636`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B10,B29,B67,C20,C51
`Chr5:15352919`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:15352937`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,B61,B8
`Chr5:15353013`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,B61,B8
`Chr5:15353066`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:15353177`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:15353465`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A19,C58,C75

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765676.1

1168 aa

584

1168

CRWN_N

CRWN_second_CC

PF27881 CRWN_N 77-374 aa PF30919 CRWN_second_CC 506-752 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765676.1`	Pfam	`PF27881`	CRWN_N	Domain	77	374	1.1e-107	360.3	CROWDED NUCLEI 2, N-terminal domain
`XP_057765676.1`	Pfam	`PF30919`	CRWN_second_CC	Coiled-coil	506	752	4e-88	295.7	CRWN second coiled-coil domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909693.1
GCACGGTTACATAACAGAAAAACAGAGGCTTTTCCGCGTCGCAATGGTTTCTCCTTTCTCTTTCATTCTGTTTAAGAAGCACACAATTTTTTGAATATTCGCCGGAGCCCGAATATTCCGTCCACTGATAGCTTCTCCGTGTTTAACTGACTACACCCACCCGCTAACGTTTAGTAACCGTTAAAACCTCACTTTTTCTAGCCGTTGTTTACAAATTTCTCAATTAGGGTTTCATCCAATTTTTCCAAGAATTGGATTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986315
ATGTTCACTCCGAAGCGGCAGTGGCAGGGGCCCTCGAGAACACCTAGGAGTGAAGTACGTACGCCAAACCCTACTGCCGGCAAGGAGAAGTTGGTGGCTTTTATCGACGGCCCTCCGCCGCCAAGGGCCTTGTTGAATGACAATGGGGATAGAGCTGAGACGGAGAATATGGATGATTGGCGAAGGTTTCGGGAGGTGGGGCTGCTGGATGAGGCGTCTTTGGAGAGGCGCGATCGAGAGGCATTACTTGAGAAAGCCCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765676.1
MFTPKRQWQGPSRTPRSEVRTPNPTAGKEKLVAFIDGPPPPRALLNDNGDRAETENMDDWRRFREVGLLDEASLERRDREALLEKAQRLESELHDYQYNMGLLLIENKEWTSKHDELHESLLEVQELLKREKAAHLIAVTQVEERETNLRKALEVERQCVAELERSLREIHAERDKIKITSDTKLADANHLVAGIQDRSLEVQQRLLAADAKLAEASRKSLEMERKLQEVETRESVLKRERMSFISERDAHEATFMKHKE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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