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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001662`

染色体: Chr05 坐标: 15727807-15729588 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001662`
名称	SmilChr05G001662
描述	uncharacterized SmilChr05G001662
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	15727807 - 15729588 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986377`
GeneID	`130986377`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986377`
原始查询	`SmilChr05G001662`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0328500; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os02g0328500; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os02g0328500` - identity=27.3; qcov=0.893; evalue=3.47e-15; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF12776 (Myb_DNA-bind_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986377

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057765767.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057765767.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765767.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765767.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057765767.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:15727945`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B9,C11,C28,C69
`Chr5:15728449`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,B27,D10
`Chr5:15728465`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:15728545`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,D10
`Chr5:15728559`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	53	A13,A15,A3,A4,A6,A9,B105,B107,B115,B121,B125,B126,B128,B133,B16,B20,B24,B3,B32,B48,B5,B51,B52,B62,B73,B74,B78,B80,B81,B89,B94,B97,B98,C13,C16,C25,C26,C3,C30,C48,C49,C50,C55,C56,C57,C6,C65,C76,C80,C86,C87,D1,D4
`Chr5:15728609`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,B82
`Chr5:15728671`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A16
`Chr5:15728679`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	A3,B11,B122,B140,C38,C85
`Chr5:15728742`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	22	A22,A7,A8,B100,B109,B113,B114,B127,B128,B139,B14,B19,B58,B71,B76,C19,C41,C49,C53,C73,C74,C81
`Chr5:15728788`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C24
`Chr5:15728890`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C24

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765767.1

168 aa

168

Myb_DNA-bind_3

PF12776 Myb_DNA-bind_3 28-123 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765767.1`	Pfam	`PF12776`	Myb_DNA-bind_3	Domain	28	123	1.4e-05	26.7	Myb/SANT-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909784.1
GCGAAAAGGGGAAAAATAACCTACATTTGAGGTTCGCCAAATCGCTCTGGTGGTATTGGTGGGGTAATCGACGGCCATCCTCGCTGGGCGATTGGACGAGAAACACATCGGTAACTTGCCGCCATGGATTTATCGCAACCGAATACAGGGAGCAACGAGGTCTTTTGCAATAGAGCGAACAAGACTAATAAAATGCGTCTTCCGTGGTCATCCAAAGAGGAGGTTGTTTTGGTGACAGCACTGAAAGAGCTCGTTGCTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986377
ATGGATTTATCGCAACCGAATACAGGGAGCAACGAGGTCTTTTGCAATAGAGCGAACAAGACTAATAAAATGCGTCTTCCGTGGTCATCCAAAGAGGAGGTTGTTTTGGTGACAGCACTGAAAGAGCTCGTTGCTGATGGATGGAAGTTCGACAATGGGTTCCGGGCGGGGTTTCTTGGTAAACTCGAAGACGCAATTAGGAAAGAATTTCTCGGGACAAATTTGAAGGTTGTGCCACACATCAACTCGAAGATCGGCAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765767.1
MDLSQPNTGSNEVFCNRANKTNKMRLPWSSKEEVVLVTALKELVADGWKFDNGFRAGFLGKLEDAIRKEFLGTNLKVVPHINSKIGTWKKNFYTLPAMLARSSIGFNSNGDHMVDCTNDQWEQIVKCDPNVRLMRYKSWPLYDSWKEIFRNDRATGDRQRILWMLSTS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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