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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001670`

染色体: Chr05 坐标: 15842794-15843665 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001670`
名称	SmilChr05G001670
描述	uncharacterized SmilChr05G001670
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	15842794 - 15843665 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025567`
GeneID	`131025567`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025567`
原始查询	`SmilChr05G001670`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0872900; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os01g0872900; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=38.3; qcov=0.798; evalue=1.18e-39; confidence=medium
Rice	`Os01g0872900` - identity=43; qcov=1.11; evalue=3.77e-77; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025567

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057811349.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057811349.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811349.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811349.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057811349.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:15842830`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr5:15842848`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B128
`Chr5:15842865`	`CAA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	141	A11,A13,A14,A16,A18,A22,A23,A25,A3,A4,A6,A7,A8,A9,B100,B103,B105,B107,B108,B109,B112,B113,B114,B115,B117,B118,B121,B124,B125,B126,B127,B128,B129,B133,B137,B138,B139,B14,B16,B19,B20,B22,B23,B24,B26,B3,B31,B32,B34,B35,B38,B39,B4,B40,B42,B43,B44,B46,B48,B5,B50,B51,B52,B54,B56,B57,B58,B59,B6,B61,B62,B64,B65,B66,B69,B71,B73,B74,B75,B76,B78,B80,B81,B84,B85,B89,B9,B91,B94,B96,B97,B98,C1,C12,C13,C14,C16,C18,C19,C20,C24,C25,C26,C28,C3,C30,C32,C37,C4,C40,C41,C43,C45,C47,C48,C49,C50,C51,C52,C53,C55,C56,C57,C6,C62,C65,C67,C68,C70,C73,C74,C76,C80,C81,C82,C86,C87,D1,D2,D4,D5
`Chr5:15842868`	`C`	`CGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	141	A11,A13,A14,A16,A18,A22,A23,A25,A3,A4,A6,A7,A8,A9,B100,B103,B105,B107,B108,B109,B112,B113,B114,B115,B117,B118,B121,B124,B125,B126,B127,B128,B129,B133,B137,B138,B139,B14,B16,B19,B20,B22,B23,B24,B26,B3,B31,B32,B34,B35,B38,B39,B4,B40,B42,B43,B44,B46,B48,B5,B50,B51,B52,B54,B56,B57,B58,B59,B6,B61,B62,B64,B65,B66,B69,B71,B73,B74,B75,B76,B78,B80,B81,B84,B85,B89,B9,B91,B94,B96,B97,B98,C1,C12,C13,C14,C16,C18,C19,C20,C24,C25,C26,C28,C3,C30,C32,C37,C4,C40,C41,C43,C45,C47,C48,C49,C50,C51,C52,C53,C55,C56,C57,C6,C62,C65,C67,C68,C70,C73,C74,C76,C80,C81,C82,C86,C87,D1,D2,D4,D5
`Chr5:15842877`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C20
`Chr5:15842896`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,B101,B70
`Chr5:15842933`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr5:15842953`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B118,C23
`Chr5:15842967`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B85
`Chr5:15843010`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,D10
`Chr5:15843036`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A8,B35,B40,C28,C43
`Chr5:15843054`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A24,B41,C42

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811349.1

262 aa

131

262

Plant_tran

PF04827 Plant_tran 40-118 aa PF04827 Plant_tran 121-212 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811349.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	40	118	9e-67	225.4	Plant transposon protein
`XP_057811349.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	121	212	9e-67	225.4	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955366.1
ATGCTAGCAAATGATGGGGCAGCTGACCAGCACAACGAGTATCAAGGGATTGCGGAGTCTACTTCGTTGGAGTGCTTGCGCCGATTCTGTCGAGTGGTCATCCAACTCTTTGGCACAACATACTTGAGGAGACCGACCCCTGCCAACTGCCAAAGGCTCATAGCAATGCACGAGGAGAAACACGGCTTCCCGGGAATACTAGGAAGTTTTGATTGCATGCACTGGGCATGGAAGAATTGTCCAACGGCATGGCAAGGAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025567
ATGCTAGCAAATGATGGGGCAGCTGACCAGCACAACGAGTATCAAGGGATTGCGGAGTCTACTTCGTTGGAGTGCTTGCGCCGATTCTGTCGAGTGGTCATCCAACTCTTTGGCACAACATACTTGAGGAGACCGACCCCTGCCAACTGCCAAAGGCTCATAGCAATGCACGAGGAGAAACACGGCTTCCCGGGAATACTAGGAAGTTTTGATTGCATGCACTGGGCATGGAAGAATTGTCCAACGGCATGGCAAGGAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811349.1
MLANDGAADQHNEYQGIAESTSLECLRRFCRVVIQLFGTTYLRRPTPANCQRLIAMHEEKHGFPGILGSFDCMHWAWKNCPTAWQGAYTRGDQGEPTIILEAVALQDLWIWKGSTGHVSSHYYKRYYLIDDIYPNWPVFGKSPTHPTNEKSKRFNVMQEAARKDIERAFGVLQAQWAIIKGPARLWSKAELSDIMFTCIILHNMIVQDEGEQATKWAEEGNDEASSSSVAARPRTGASVEFRAYVARQASMRDAKMHVSL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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