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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001677`

染色体: Chr05 坐标: 15884840-15886910 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001677`
名称	SmilChr05G001677
描述	homologous-pairing protein 2 homolog
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	15884840 - 15886910 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986366`
GeneID	`130986366`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986366`
原始查询	`SmilChr05G001677`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	homologous-pairing protein 2 homolog
产物	homologous-pairing protein 2 homolog
Arabidopsis	`AT1G13330` (AHP2) Tat-binding protein 1(Tbp-1)-interacting protein (TBPIP) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837893] identity=69.9; qcov=1; evalue=1.63e-118; confidence=high
Rice	`Os03g0710100` - identity=68; qcov=0.982; evalue=1.28e-111; confidence=high
GO	GO:0000709 (meiotic joint molecule formation); GO:0000794 (condensed nuclear chromosome); GO:0003690 (double-stranded DNA binding); GO:0007129 (homologous chromosome pairing at meiosis); GO:0010774 (meiotic strand invasion involved in reciprocal meiotic recombination); GO:0120230 (recombinase activator activity); GO:0120231 (DNA recombinase auxiliary factor complex)
KEGG	-
Pfam	PF07106 (WHD_TBPIP); PF18517 (LZ3wCH)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986366

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057765746.1`
2	Chromosome	染色体	0.80000	`XP_057765746.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057765746.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057765746.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765746.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:15885595`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B134,B23,C3,D11
`Chr5:15885620`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B12,B125,B89,C50,C72
`Chr5:15885657`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C19
`Chr5:15885672`	`T`	`TCG`	2bp_insertion	frameshift_variant	11	A10,B10,B125,B15,B5,B74,B81,B89,C19,C30,C8
`Chr5:15885679`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	5	B99,C20,C49,C57,D3
`Chr5:15885679`	`A`	`AC`	1bp_insertion	CDS_variant	5	B99,C20,C49,C57,D3
`Chr5:15885703`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	C5,C81
`Chr5:15885703`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	C5,C81
`Chr5:15885746`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A24,B41,C42
`Chr5:15886530`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765746.1

226 aa

113

226

WHD_TBPIP

LZ3wCH

PF07106 WHD_TBPIP 8-68 aa PF18517 LZ3wCH 149-206 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765746.1`	Pfam	`PF07106`	WHD_TBPIP	Domain	8	68	1.3e-24	86.5	TBPIP/Hop2 winged helix domain
`XP_057765746.1`	Pfam	`PF18517`	LZ3wCH	Domain	149	206	2.1e-16	60.4	Leucine zipper with capping helix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909763.1
TATGAGCTTATGTGCACAGGTTACCAATACGGCGTCGTTTGGAGCTGGCGGTAAAGGCATAAAAAAGTTCAATATTCTCTCGTGCGAAGCAAGTTTTTTCTCCCAGAGAAGGTTTTCCCGCTCTTCGAGCTATCAGATCCATGGCTCCCAAATCGGATAGTGCTGAAGGAATCGTCCTCAACTTCGTGAATGAGCAAAATAGGCCTTTGAATTCACAAAATGTGGCCGATTCTTTGCAAAAGTTTAATCTAAAAAAGGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986366
ATGGCTCCCAAATCGGATAGTGCTGAAGGAATCGTCCTCAACTTCGTGAATGAGCAAAATAGGCCTTTGAATTCACAAAATGTGGCCGATTCTTTGCAAAAGTTTAATCTAAAAAAGGCTGCCATACAAAAAGCGTTGGATTGTCTTGCAGACGGTGGGAAAATATCGTTCAAAGAGTATGGCAAGCAGAAAATATACCTGGCTAGGCAAGATCAGTTCAACATCCCAAACAGCGAAGAGCTCAATCAGATGAAAGAACA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765746.1
MAPKSDSAEGIVLNFVNEQNRPLNSQNVADSLQKFNLKKAAIQKALDCLADGGKISFKEYGKQKIYLARQDQFNIPNSEELNQMKEQNSKLQEQLAERKKAISEVEAEIKALQSNLTLDQIQARKIQLGNEVKQMENKLTKLRQGVTLVSPEQRQAVEKMYMDMMNQWRRRKRMFRDVWSAITENSPKNLNEFKEELGLEYDEDCGVSLQSFDDLMHGVNKRARRQ

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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