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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001689`

染色体: Chr05 坐标: 16022221-16025040 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001689`
名称	SmilChr05G001689
描述	protein NRT1/ PTR FAMILY 3.1-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	16022221 - 16025040 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986336`
GeneID	`130986336`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986336`
原始查询	`SmilChr05G001689`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein NRT1/ PTR FAMILY 3.1-like
产物	protein NRT1/ PTR FAMILY 3.1-like
Arabidopsis	`AT1G68570` (AT1G68570) Major facilitator superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843186] identity=69.1; qcov=0.974; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0264500` - identity=60.6; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005886 (plasma membrane); GO:0022857 (transmembrane transporter activity); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF00854 (PTR2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986336

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057765712.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057765712.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765712.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765712.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057765712.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:16022471`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C31
`Chr5:16022477`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C31
`Chr5:16022546`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C31
`Chr5:16022580`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B109,B24,C74,D9
`Chr5:16022602`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr5:16022622`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr5:16022627`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B109,C74
`Chr5:16022633`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B24,B3,B78,C68,D9
`Chr5:16022701`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	B23,B24,B3,B78,C32,C68,D9
`Chr5:16022706`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B82,C29,C44
`Chr5:16022707`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B48
`Chr5:16022711`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	156	A1,A14,A2,A21,A23,A24,A4,A5,A7,A9,B1,B100,B101,B102,B103,B105,B107,B108,B109,B111,B117,B119,B12,B120,B121,B122,B124,B127,B128,B129,B130,B131,B133,B137,B139,B15,B16,B17,B18,B19,B2,B20,B21,B23,B25,B29,B3,B30,B31,B32,B36,B38,B39,B41,B42,B47,B48,B5,B52,B54,B55,B57,B59,B6,B60,B62,B66,B67,B69,B70,B72,B73,B74,B75,B8,B80,B81,B83,B84,B85,B86,B87,B9,B91,B93,B94,B95,B96,B98,C1,C10,C11,C12,C15,C16,C19,C21,C22,C23,C24,C25,C27,C28,C3,C30,C31,C33,C34,C37,C38,C39,C40,C42,C46,C47,C48,C49,C5,C50,C51,C53,C54,C55,C56,C57,C59,C6,C60,C61,C63,C64,C65,C66,C67,C68,C7,C71,C73,C74,C75,C76,C78,C79,C8,C81,C84,C85,C87,D10,D11,D4,D5,D6,D7,D8,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765712.1

578 aa

289

578

PTR2

PF00854 PTR2 86-510 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765712.1`	Pfam	`PF00854`	PTR2	Family	86	510	2.9e-92	310.3	POT family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909729.1
TTTAGGACATATATATATAGACGAGTCAATTTATAATTCTTAAATTTAAGGAAAATAACATAAATATATATATGCTGATAGATATAGGAAGATAAAGCAAGTTGAGTTATCTCACCGATATTGTGGAGAGTTTTTGAAACTCATCTTACCTAAAAACCACATATTTTCCTGCTATTTTTTTTTTTTTTTTTTGGAGGGATATGAACACTTACAGTGCGAAAGTGACAGATCAAGTCGAGGTTCACTTACTATAAAATGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986336
ATGGCCACGATGAAGAAGAAAGACTTAAACGTGGAAAGGAAACAAGGCGGCTTGATCACAATGCCCTTCATCTTCGGTAATGAAGTCGGTGAGAAATTGGCCGTGGTAGGGTTTAGCACAAACATGATCAGCTACTTAACCGGGCAGCTCCACCTGCCCATGACTAAGGCCGCCAACACTCTCACAAACTTCGGCGGCACCGGAGCCCTCACACCGCTGCTCGGCGCCTTCATTTCCGACGCCTTCGCCGGGAGGTTTTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765712.1
MATMKKKDLNVERKQGGLITMPFIFGNEVGEKLAVVGFSTNMISYLTGQLHLPMTKAANTLTNFGGTGALTPLLGAFISDAFAGRFWTITIASVLLQLGMISLTISAILPSLRPPACKGGAACKEADSGQLAFLYVSLLLSALGSGGYRPCIVSFGADQFDENDPRQKVTTWKFFNWYYFCMGASILVANTVIVYIQDNAGWGWGLAVPTFAMFVSIVAFVFGYPLYRKLDPAGSPFTRLVQVSAAAYRKRKLGRVSDPS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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