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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001694`

染色体: Chr05 坐标: 16135403-16137975 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001694`
名称	SmilChr05G001694
描述	NDR1/HIN1-like protein 10
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	16135403 - 16137975 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025570`
GeneID	`131025570`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025570`
原始查询	`SmilChr05G001694`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	NDR1/HIN1-like protein 10
产物	NDR1/HIN1-like protein 10
Arabidopsis	`AT2G27260` (AT2G27260) Late embryosis abundant (LEA) hydroxyproline-rich glycoprotein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817268] identity=37.9; qcov=0.708; evalue=5.81e-39; confidence=medium
Rice	`Os07g0531500` (P0681F05.132) - identity=28.2; qcov=0.56; evalue=1.22e-19; confidence=low
GO	GO:0005886 (plasma membrane)
KEGG	-
Pfam	PF03168 (LEA_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025570

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057811351.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057811351.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811351.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811351.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057811351.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:16135630`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	A21,B140,C28
`Chr5:16135630`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B140,C28
`Chr5:16135631`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B60,C21,C64,C74
`Chr5:16135637`	`CGA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	5	B12,B15,B38,B56,C26
`Chr5:16135637`	`CGA`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	5	B12,B15,B38,B56,C26
`Chr5:16135648`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	B26,B43,B55,C78
`Chr5:16135648`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	4	B26,B43,B55,C78
`Chr5:16135649`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	B26,B43,B55,C78
`Chr5:16135649`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	4	B26,B43,B55,C78
`Chr5:16135661`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B26,B43,C78
`Chr5:16135700`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A7,B46,C5,C52
`Chr5:16135716`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	22	A14,A16,A25,B118,B22,B31,B40,B46,B56,B64,B71,B91,B96,C1,C12,C37,C51,C52,C62,C80,D11,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811351.1

291 aa

146

291

LEA_2

PF03168 LEA_2 90-186 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811351.1`	Pfam	`PF03168`	LEA_2	Domain	90	186	2.3e-07	31.9	Late embryogenesis abundant protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955368.1
ATGGATGATCTTAGAAATGGACAGGTTGTGGGCTCCATCCCCTACCAGCAGCAGAACTACCAATACGACGCCGAGTCCGTCCGCCGCGCCACCTGCCTCCGCCGCATCTTCGCTTTCGTGATCGGCCTCATCGTCATCTTCGGCACAGTCACCTTCATCATCTGGCTCATCCTCCGCCCCCAGCTCCCCGAGTTTCGAGTCGACTCCTTGTCTATCTCCAATTTCACGCTCGGCAACGACTTGCTCATCTCCTTCACCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025570
ATGGATGATCTTAGAAATGGACAGGTTGTGGGCTCCATCCCCTACCAGCAGCAGAACTACCAATACGACGCCGAGTCCGTCCGCCGCGCCACCTGCCTCCGCCGCATCTTCGCTTTCGTGATCGGCCTCATCGTCATCTTCGGCACAGTCACCTTCATCATCTGGCTCATCCTCCGCCCCCAGCTCCCCGAGTTTCGAGTCGACTCCTTGTCTATCTCCAATTTCACGCTCGGCAACGACTTGCTCATCTCCTTCACCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811351.1
MDDLRNGQVVGSIPYQQQNYQYDAESVRRATCLRRIFAFVIGLIVIFGTVTFIIWLILRPQLPEFRVDSLSISNFTLGNDLLISFTSKIKLTAKNPNKKMKLGYDHIETAIYYQSYSLSETTVAPFYQGTKNETSLTARFAAAGSFLEKVAVDEITGERGKNDNVNFNLRMLSRFRFEAKVWRTRRRFLKVFCGDLVLGLPTSGRSGVLTGGPRQCRVEAFPLSLNHQNRFPCPFSPLSSLISLCFSPLSLSLPPPLLTS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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