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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001696`

染色体: Chr05 坐标: 16145172-16147226 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001696`
名称	SmilChr05G001696
描述	uncharacterized SmilChr05G001696
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	16145172 - 16147226 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986334`
GeneID	`130986334`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986334`
原始查询	`SmilChr05G001696`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Cysteine/Histidine-rich C1 domain family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825081]; symbol=AT3G59120; hit=AT3G59120; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Cysteine/Histidine-rich C1 domain family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825081]; symbol=AT3G59120; hit=AT3G59120; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G59120` (AT3G59120) Cysteine/Histidine-rich C1 domain family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825081] identity=28.1; qcov=0.742; evalue=4.6e-32; confidence=low
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03107 (C1_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986334

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057765708.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057765708.1`
3	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057765708.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057765708.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765708.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:16145390`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B11,B122,B140,C38,C85
`Chr5:16145608`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B137,B54,C40
`Chr5:16145608`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B137,B54,C40
`Chr5:16145622`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B76,C53
`Chr5:16145677`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C20
`Chr5:16145677`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C20
`Chr5:16145788`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B36
`Chr5:16145815`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B137,B54,C40
`Chr5:16145836`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B128,C82
`Chr5:16145875`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A16
`Chr5:16145912`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,B21,D11
`Chr5:16146039`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A16

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765708.1

619 aa

310

619

C1_2

PF03107 C1_2 143-196 aa PF03107 C1_2 206-251 aa PF03107 C1_2 484-534 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765708.1`	Pfam	`PF03107`	C1_2	Domain	143	196	7.8e-37	126.1	C1 domain
`XP_057765708.1`	Pfam	`PF03107`	C1_2	Domain	206	251	7.8e-37	126.1	C1 domain
`XP_057765708.1`	Pfam	`PF03107`	C1_2	Domain	484	534	7.8e-37	126.1	C1 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909725.1
CCATCTGTGTAGCAAAATGGATCATGAAATAAGAATTCCTAATCAGCGTCTTTTAGCAGCATTAGATCCACGTGGTGCAGAATCGATTAGATTTCACAGTAAGCACAAGCAAGAAAACAATATCGATCCCGACGATGGGAATTCTAGGCTATGCGTTGCTTGCATGCAGCCAATCTTCTCAACTCCATTCAAAGCGCTGGAGTCGAGAAGCGGCGGCGCCGCTCGCTATCTGCACGATCATTGCAGTGCTCTTCCTAGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986334
ATGGATCATGAAATAAGAATTCCTAATCAGCGTCTTTTAGCAGCATTAGATCCACGTGGTGCAGAATCGATTAGATTTCACAGTAAGCACAAGCAAGAAAACAATATCGATCCCGACGATGGGAATTCTAGGCTATGCGTTGCTTGCATGCAGCCAATCTTCTCAACTCCATTCAAAGCGCTGGAGTCGAGAAGCGGCGGCGCCGCTCGCTATCTGCACGATCATTGCAGTGCTCTTCCTAGAGAATTAGAGGACAACGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765708.1
MDHEIRIPNQRLLAALDPRGAESIRFHSKHKQENNIDPDDGNSRLCVACMQPIFSTPFKALESRSGGAARYLHDHCSALPRELEDNDLHPSLEPLRLQLNLHKSRCSKCNAVCGDVLYRCRDQQCDFQLDMICARTVKIVHRSHDHRLTVIRSGADASFACGACGTEHRPGLLWAHPTFLVYVCNACGFWLHPHCATLPNAILLHQHLHPLLLNYGSRSSMRQCAICRDVVASWGVYSCTKCDYYVHIMCAVADNQSFKP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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