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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001700`

染色体: Chr05 坐标: 16208129-16212518 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001700`
名称	SmilChr05G001700
描述	uncharacterized SmilChr05G001700
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	16208129 - 16212518 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986332`
GeneID	`130986332`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986332`
原始查询	`SmilChr05G001700`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	GO:0006508 (proteolysis); GO:0008234 (cysteine-type peptidase activity)
KEGG	-
Pfam	PF02902 (Peptidase_C48)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986332

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057765705.1`
2	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057765705.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057765705.1`
4	Nuclear body	核内小体	0.20000	`XP_057765705.1`
5	PML body	PML body	0.20000	`XP_057765705.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:16210205`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D9
`Chr5:16210215`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	9	A1,A14,A19,B129,B25,B69,B95,C64,D9
`Chr5:16210231`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B64
`Chr5:16210239`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C12,C47,C52
`Chr5:16210246`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B57,C63,C7
`Chr5:16210253`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B77,B92
`Chr5:16210259`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B52,C40
`Chr5:16210263`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B110,B119,B59
`Chr5:16210265`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C45
`Chr5:16210266`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,B129,C59,D2
`Chr5:16210284`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr5:16210292`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A8,B50,B57,C86,C87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765705.1

649 aa

324

649

Peptidase_C48

PF02902 Peptidase_C48 503-644 aa

XP_057765706.1

645 aa

322

645

Peptidase_C48

PF02902 Peptidase_C48 499-640 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765705.1`	Pfam	`PF02902`	Peptidase_C48	Domain	503	644	0.00011	22.9	Ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain
`XP_057765706.1`	Pfam	`PF02902`	Peptidase_C48	Domain	499	640	0.00011	22.9	Ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909722.1
AGCTAAAGCTAATTCAATTGTGATTGGACAATTCAACCGGCAAGGGTGAAGCTTTATAGGGTGAGAATCTATAGGCTTTGCAGCAAATTAACTCACGGGCGGCTAGAATTGAGCGGGCACTGCTTTTTGTGGGATTTGTTTGAAAAAATTGAAGATTTGATAAGAGAGATAAATTGGGTAGGGCCCATTTACACAATATTTTATGTTAAATTAGGGTATTGGGGTAGAGAAGCAGCCGCACTTGAGAGAAGGAAAAAATC...

XM_057909723.1
AGCTAAAGCTAATTCAATTGTGATTGGACAATTCAACCGGCAAGGGTGAAGCTTTATAGGGTGAGAATCTATAGGCTTTGCAGCAAATTAACTCACGGGCGGCTAGAATTGAGCGGGCACTGCTTTTTGTGGGATTTGTTTGAAAAAATTGAAGATTTGATAAGAGAGATAAATTGGGTAGGGCCCATTTACACAATATTTTATGTTAAATTAGGGTATTGGGGTAGAGAAGCAGCCGCACTTGAGAGAAGGAAAAAATC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130986332
ATGATCCCCGATGAGTACGAGGCCACGACATCTTACTGGCTATCGGTGGCAGGTGTCAATGCCGGGATAGGGGTTCGAGTACCAGAGCCGGGAGTCTTTGGTCATAGGCAGCCTCGGGCGCGCTACACTGGTGGGGACCACAACGAGGATGCTCCTGAGCATCAACCTCGGCGTCGCAGTATGAGACAGGATACTGGCAAGCGCCCGAGGGGACAACTAGTGGACACCTCATCGAGCAGCAGCCATCACGATCAGAGCAT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057765705.1
MIPDEYEATTSYWLSVAGVNAGIGVRVPEPGVFGHRQPRARYTGGDHNEDAPEHQPRRRSMRQDTGKRPRGQLVDTSSSSSHHDQSIGGDHPVDSGRRSHSHRAPRPRHEDAPAPSQWSEEDWQRMQHMMRESEGRIARNVEDSLFRRIKNWFEDKLDAMRCRCSHSTDVHVPRPAPRSHSDRRREPQPEPDSDPAQPTSSEAPSHHRSPAHESPAREVGQTTGDAMHTPQWQHDPFGGPTSFGHVQTPHMGVHHMPTFE...

XP_057765706.1
MIPDEYEATTSYWLSVAGVNAGIGVRVPEPGVFGHRQPRARYTGGDHNEDAPEHQPRRRSMRQDTGKRPRGQLVDTSSSSSHHDQSIGGDHPVDSGRRSHSHRAPRPRHEDAPAPSQWSEEDWQRMQHMMRESEGRIARNVEDSLFRRIKNWFEDKLDAMRCRCSHSTDVHVPRPAPRSHSDRRREPQPEPDSDPAQPTSSEAPSHHRSPAHESPAREVGQTTGDAMHTPQWQHDPFGGPTSFGHVQTPHMGVHHMPTFE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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