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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001715`

染色体: Chr05 坐标: 16423359-16426134 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001715`
名称	SmilChr05G001715
描述	DNA-directed RNA polymerases II, IV and V subunit 11
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	16423359 - 16426134 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986380`
GeneID	`130986380`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986380`
原始查询	`SmilChr05G001715`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DNA-directed RNA polymerases II, IV and V subunit 11
产物	DNA-directed RNA polymerases II%2C IV and V subunit 11
Arabidopsis	`AT3G52090` (NRPB11) DNA-directed RNA polymerase, RBP11-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824372] identity=84.2; qcov=0.95; evalue=2.45e-71; confidence=high
Rice	`Os07g0172500` - identity=82.4; qcov=0.9; evalue=1.43e-65; confidence=high
GO	GO:0001055 (GO:0001055); GO:0003677 (DNA binding); GO:0005665 (RNA polymerase II, core complex); GO:0006366 (transcription by RNA polymerase II); GO:0046983 (protein dimerization activity)
KEGG	smil03020 (RNA polymerase - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil03420 (Nucleotide excision repair - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01193 (RNA_pol_L); PF13656 (RNA_pol_L_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986380

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057765770.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.80000	`XP_057765770.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057765770.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057765770.1`
5	Chromatin	染色质	0.40000	`XP_057765770.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:16424251`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,C85
`Chr5:16424254`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B137,B54,C40
`Chr5:16424372`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B130
`Chr5:16424373`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A5,B8,B84,C58
`Chr5:16424397`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,B8,B84
`Chr5:16425911`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765770.1

120 aa

120

RNA_pol_L_2

RNA_pol_L

PF13656 RNA_pol_L_2 30-103 aa PF01193 RNA_pol_L 32-97 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765770.1`	Pfam	`PF13656`	RNA_pol_L_2	Domain	30	103	9.8e-30	102.8	RNA polymerase Rpb3/Rpb11 dimerisation domain
`XP_057765770.1`	Pfam	`PF01193`	RNA_pol_L	Domain	32	97	1.1e-07	32.1	RNA polymerase Rpb3/Rpb11 dimerisation domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909787.1
AAAGCTTTCCTAAGAATATTAGATATTGGCCTAGTCCTACGGATGATTCGATTTGTCTTTAATTTTTTATTAATTAATTAAATTTCAATATGAATTAGAAATTTATAATTAATTTATTAGAATTTAGAAATCGGCTTCTCTCATCCCTCCTCTCACTCTCGTCTCTCTACGTCTCTTGTCGCCGCCGCCGACAACACACCAAGAAGCAATCAGCACATCCGGCTCGCCTCTCCCCATCTCCTCCGTCCTCACTCTGCTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986380
ATGAATGCCCCCGATCGTTACGAGCGATTCGTCGTCCCGGAGGGCGTCTCTAAGGTTTCGTACGAGAGGGACACGAAGATCATCAATGCGGCGACATTCACCGTCGAGCGTGAGGACCACACCATCGGCAACATTCTCCGCATGCAATTGCACAGAGATGAGAATGTTTTGTTTGCTGGCTACAAGCTGCCCCACCCTCTTCAGTACAAAATACTCATAAGGATCCAAACAACAAGCCAATCTTCGCCAATGCAGGCCTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765770.1
MNAPDRYERFVVPEGVSKVSYERDTKIINAATFTVEREDHTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPLQYKILIRIQTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELDHLKNAFEVELAKHAGSQHREF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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