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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001717`

染色体: Chr05 坐标: 16434592-16436748 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001717`
名称	SmilChr05G001717
描述	uncharacterized SmilChr05G001717
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	16434592 - 16436748 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025573`
GeneID	`131025573`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025573`
原始查询	`SmilChr05G001717`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0292200; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os12g0292200; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`AT2G06105` (AT2G06105) aspartyl protease gag-polyprotein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28717693] identity=37.5; qcov=0.131; evalue=9.58e-08; confidence=weak
Rice	`Os12g0292200` - identity=42.9; qcov=0.127; evalue=1.03e-11; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13650 (Asp_protease_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025573

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057811356.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057811356.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057811356.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811356.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811356.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:16434671`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr5:16434842`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B105
`Chr5:16436203`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B28,C2,C3,C7
`Chr5:16436211`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B28,C2,C3,C7
`Chr5:16436212`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B28,C2,C3,C7
`Chr5:16436213`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C23,C67
`Chr5:16436233`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C23,C67
`Chr5:16436244`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	A8,B28,C2,C3,C7
`Chr5:16436244`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A8,B28,C2,C3,C7
`Chr5:16436276`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B28,C2,C55,C7
`Chr5:16436286`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:16436296`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C24,C54

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811356.1

551 aa

276

551

Asp_protease_2

PF13650 Asp_protease_2 184-275 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811356.1`	Pfam	`PF13650`	Asp_protease_2	Domain	184	275	1.8e-05	26.1	Aspartyl protease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955373.1
ATGATCAAAGAAGAGAAGAAGCTCAACCTTGAAGAAATATTGATGAAGTTCATGACCACGACTCAAGCTCACATGACAAGAACGGATGAGAAGTTAGAGGCTCAAGCCAAGCAATTGAAAATGCTTGAGATACAAGTGGGACAAATTGCCGAGTCTATAAACAATCAACACCAACAAGGGCAATTCCCAAGCAACACAATCGTGAATCCCAAGGAGCATTGCAAGGCCATTGCTCTAAGGAGTGGGACAACATATGAAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025573
ATGATCAAAGAAGAGAAGAAGCTCAACCTTGAAGAAATATTGATGAAGTTCATGACCACGACTCAAGCTCACATGACAAGAACGGATGAGAAGTTAGAGGCTCAAGCCAAGCAATTGAAAATGCTTGAGATACAAGTGGGACAAATTGCCGAGTCTATAAACAATCAACACCAACAAGGGCAATTCCCAAGCAACACAATCGTGAATCCCAAGGAGCATTGCAAGGCCATTGCTCTAAGGAGTGGGACAACATATGAAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811356.1
MIKEEKKLNLEEILMKFMTTTQAHMTRTDEKLEAQAKQLKMLEIQVGQIAESINNQHQQGQFPSNTIVNPKEHCKAIALRSGTTYEEPKMPDEEDRSGVVVEVGDGNPSKEQGDRGKKKEVHINIPLIEALKQMPSYAKFLKEVISNKRKMGENETVNLTEECSAVLQRKIPTKIKDPGSFTIPCDIGNDRFGKALCDLGASINLMPLSIFNKLEIGTIKPTTIALQMADRSVSYPKGIVEDVLVKVNNFIFPVDFVVLD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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