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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001719`

染色体: Chr05 坐标: 16468271-16470023 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001719`
名称	SmilChr05G001719
描述	adenylate isopentenyltransferase-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	16468271 - 16470023 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986359`
GeneID	`130986359`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986359`
原始查询	`SmilChr05G001719`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	adenylate isopentenyltransferase-like
产物	adenylate isopentenyltransferase-like
Arabidopsis	`AT1G68460` (IPT1) isopentenyltransferase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843175] identity=50.2; qcov=0.818; evalue=4.02e-97; confidence=high
Rice	`Os05g0551700` (OsIPT7) - identity=42.4; qcov=0.834; evalue=1.11e-65; confidence=medium
GO	GO:0005739 (mitochondrion); GO:0006400 (tRNA modification); GO:0009691 (cytokinin biosynthetic process); GO:0009824 (AMP dimethylallyltransferase activity); GO:0052381 (tRNA dimethylallyltransferase activity)
KEGG	smil00908 (Zeatin biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01715 (IPPT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986359

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057765734.1`
2	Chloroplast	叶绿体	0.40000	`XP_057765734.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057765734.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765734.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765734.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:16468765`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B138,B94
`Chr5:16468908`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C7,D11
`Chr5:16469091`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B86,C24,C32,C68
`Chr5:16469134`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B86,C24,C32,C68
`Chr5:16469235`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B117,B46
`Chr5:16469390`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B11,B140,B37,C85
`Chr5:16469408`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B71,C33,C62
`Chr5:16469453`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B110,B45,B95
`Chr5:16469694`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B101
`Chr5:16469694`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B101
`Chr5:16469750`	`GGA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	B17,B18,B89,C13
`Chr5:16469750`	`GGA`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	4	B17,B18,B89,C13

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765734.1

373 aa

186

373

IPPT

PF01715 IPPT 114-192 aa PF01715 IPPT 207-316 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765734.1`	Pfam	`PF01715`	IPPT	Domain	114	192	8.2e-30	105.0	IPP transferase
`XP_057765734.1`	Pfam	`PF01715`	IPPT	Domain	207	316	8.2e-30	105.0	IPP transferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909751.1
TCACTAGTCAGTCTCACACCGTCAAACACTCGGCTCAAATATATAGATACACACAAGCACAAAAAAATAAAATGAAGAGAGGGAGAAGAGAGAGAGCGAAGAATCAAGTGAAGTATATATAAAATGAAGGAATGAAGAAGAAGAAGAAGCTATATATATACATATTTATTTATGAGGGCCAACAGCTCAAGACAAAAGTGCCGTACAATTGTGCTTAACAACTCTTCATCCATTCCTCATTCCCTTGTGATCAGGTGCGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986359
ATGAGGGCCAACAGCTCAAGACAAAAGTGCCGTACAATTGTGCTTAACAACTCTTCATCCATTCCTCATTCCCTTGTGATCAGGTGCGGCTCTCTCTCTCTCCAGCGGCATTCGCATTGCTTGGTTTTCCTTATGAGAAGATTATCATCATTCTTTTTAAAGAGCCATCACTTCCCTTACAAAACCCTCTCTCTCCCACCGCGGCGGCCCCACATGTCCTCCCGCCCCCGCAAAATCGTGGTAGTGATGGGCCCCACGGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765734.1
MRANSSRQKCRTIVLNNSSSIPHSLVIRCGSLSLQRHSHCLVFLMRRLSSFFLKSHHFPYKTLSLPPRRPHMSSRPRKIVVVMGPTGCGKTKLSIDLISRFFPSSEIINSDKIQVYRGLDITTNKIPLPDRRNVRHHLLGDFDPSDSHPEFTPSDFRSAASQAVSQILARRRIPFIVGGSNSLIYALLANKFNPDCDVFTQADSAFCKEQRYECCFIYVDVALPVLNQYLIKRVDDMLESGMFEELAAYFASPESESVRE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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