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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001720`

染色体: Chr05 坐标: 16474855-16475799 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001720`
名称	SmilChr05G001720
描述	uncharacterized SmilChr05G001720
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	16474855 - 16475799 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025574`
GeneID	`131025574`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025574`
原始查询	`SmilChr05G001720`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`AT4G29090` (AT4G29090) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829030] identity=22.4; qcov=0.965; evalue=5.43e-10; confidence=weak
Rice	`Os02g0118800` - identity=23.4; qcov=0.939; evalue=4.28e-15; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025574

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057811357.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057811357.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057811357.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811357.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811357.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:16474877`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B126,B33,B73,B9,D3
`Chr5:16474902`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,B66
`Chr5:16474919`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B73,B9,C26,D3
`Chr5:16474936`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C26
`Chr5:16474936`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C26
`Chr5:16474939`	`T`	`TAA`	2bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	1	C26
`Chr5:16474939`	`T`	`TAA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C26
`Chr5:16474940`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C26
`Chr5:16474940`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C26
`Chr5:16474943`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B129,B42,B43,B58,D3
`Chr5:16474953`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr5:16475000`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811357.1

314 aa

157

314

zf-RVT

PF13966 zf-RVT 115-209 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811357.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	115	209	1.1e-14	55.5	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955374.1
ATGAAGGCGTCAAGACCTGCCGGAAAATGGTTCCATAATAATTTGAAGAGGGTCATCGGGGATGGAAGAGACACTAGTTTCTGGTCATGTGTTTGGTTGGGAAGTCGGCCCCTCAAGGATGAATTCCCAAGATTATTTTGGCTTTGTGAAGATAGAAATGCAACTGTGAATGATATGGGGAAATGGTGTGACGGGAGATGGGTTTGGGAGGTAAAGTGGAAATGCGAACTGAGGGAGAGAGAAGTGGAATCTGTCAACTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025574
ATGAAGGCGTCAAGACCTGCCGGAAAATGGTTCCATAATAATTTGAAGAGGGTCATCGGGGATGGAAGAGACACTAGTTTCTGGTCATGTGTTTGGTTGGGAAGTCGGCCCCTCAAGGATGAATTCCCAAGATTATTTTGGCTTTGTGAAGATAGAAATGCAACTGTGAATGATATGGGGAAATGGTGTGACGGGAGATGGGTTTGGGAGGTAAAGTGGAAATGCGAACTGAGGGAGAGAGAAGTGGAATCTGTCAACTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811357.1
MKASRPAGKWFHNNLKRVIGDGRDTSFWSCVWLGSRPLKDEFPRLFWLCEDRNATVNDMGKWCDGRWVWEVKWKCELREREVESVNSLMETISGFPPCAGKKDTWEWKADKGGVYSTNSAYRAIKDLNQTNQTCDNASMQFRKLWKAPATQKARMTAWRALKNRLPTCDNLIKRNVELGLVERSCTACFHAVESVSHTLILCPKTEAVWDNIYGWLGVFTARPASIPDHFLSFIHLGKGKKWHRFLKALWCCSIWVLWRR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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