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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001723`

染色体: Chr05 坐标: 16501430-16503046 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001723`
名称	SmilChr05G001723
描述	uncharacterized SmilChr05G001723
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	16501430 - 16503046 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025575`
GeneID	`131025575`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025575`
原始查询	`SmilChr05G001723`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G43760` (AT1G43760) DNAse I-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840968] identity=26.5; qcov=0.814; evalue=1.02e-41; confidence=low
Rice	`Os06g0484800` - identity=27.9; qcov=0.833; evalue=1.07e-43; confidence=low
GO	GO:0003824 (catalytic activity)
KEGG	-
Pfam	PF03372 (Exo_endo_phos); PF14529 (Exo_endo_phos_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025575

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057811358.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057811358.1`
3	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057811358.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811358.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811358.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:16501455`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B41,B71,B89,C70
`Chr5:16501467`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	20	A10,A5,B1,B101,B102,B104,B115,B121,B13,B15,B40,B48,B54,B68,B89,C36,C61,C83,C87,D4
`Chr5:16501480`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B43,B55
`Chr5:16501480`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B43,B55
`Chr5:16501498`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B43,B55
`Chr5:16501569`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	C16,C7
`Chr5:16501569`	`G`	`GC`	1bp_insertion	CDS_variant	2	C16,C7
`Chr5:16501570`	`T`	`TGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	C16,C7
`Chr5:16501570`	`T`	`TGC`	2bp_insertion	CDS_variant	2	C16,C7
`Chr5:16501617`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A10,C83
`Chr5:16501636`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A19,A21,B41
`Chr5:16501666`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C24

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811358.1

538 aa

269

538

Exo_endo_phos

Exo_endo_phos_2

PF03372 Exo_endo_phos 4-227 aa PF14529 Exo_endo_phos_2 105-230 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811358.1`	Pfam	`PF03372`	Exo_endo_phos	Domain	4	227	1e-12	49.0	Endonuclease/Exonuclease/phosphatase family
`XP_057811358.1`	Pfam	`PF14529`	Exo_endo_phos_2	Domain	105	230	1.5e-07	32.0	Endonuclease-reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955375.1
ATGATTGTGATTTCATACAATGTTAGAGGCTTGGGGAGTTTTGTTAAACAGAAAGATTGTGGTGATCTCATTAGGGTGGAGAAAGCAGATTTGTGTTTTATACAGGAGACTAAACTTGAATCTCTTTCTGTTTCTATTTGTTCTAATTGGTGGGGTGTTGATAATTGCGATTGGGCTGTTAGAAATTCGGAAGGTAGATCAGGCGGCATCCTGTGCGTTTGGAATAAAGATTTGTTCTCGGTCTCTAGTAAGTGGGATTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025575
ATGATTGTGATTTCATACAATGTTAGAGGCTTGGGGAGTTTTGTTAAACAGAAAGATTGTGGTGATCTCATTAGGGTGGAGAAAGCAGATTTGTGTTTTATACAGGAGACTAAACTTGAATCTCTTTCTGTTTCTATTTGTTCTAATTGGTGGGGTGTTGATAATTGCGATTGGGCTGTTAGAAATTCGGAAGGTAGATCAGGCGGCATCCTGTGCGTTTGGAATAAAGATTTGTTCTCGGTCTCTAGTAAGTGGGATTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811358.1
MIVISYNVRGLGSFVKQKDCGDLIRVEKADLCFIQETKLESLSVSICSNWWGVDNCDWAVRNSEGRSGGILCVWNKDLFSVSSKWDFPGAVIIIGVWKPNNLRCCFVNVYAPSDSPAKNVLWERLRSVIEQNKDLCLCMVGDFNAIREPGERVGMGESHGISEMKKFDTFIRECEVIEIRTLGRLFTWYQPNGRCKSKLDRFLVNENWISAWPSTCGRVLQRSLSDHCPILLSTKSVDWGPKPFRFLNAWTSHPDFLQVV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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