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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001733`

染色体: Chr05 坐标: 16739007-16741855 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001733`
名称	SmilChr05G001733
描述	pectinesterase-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	16739007 - 16741855 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986402`
GeneID	`130986402`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986402`
原始查询	`SmilChr05G001733`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pectinesterase-like
产物	pectinesterase-like
Arabidopsis	`AT1G23200` (AT1G23200) Plant invertase/pectin methylesterase inhibitor superfamily [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838928] identity=51.1; qcov=0.978; evalue=2.81e-163; confidence=high
Rice	`Os07g0675100` (OsPME22) - identity=46.7; qcov=0.879; evalue=6.46e-129; confidence=high
GO	GO:0030599 (pectinesterase activity); GO:0042545 (cell wall modification); GO:0046910 (pectinesterase inhibitor activity)
KEGG	-
Pfam	PF01095 (Pectinesterase); PF04043 (PMEI)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986402

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	1.00000	`XP_057765781.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.40000	`XP_057765781.1`
3	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057765781.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057765781.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765781.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:16739783`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B57,B86,C24,C32,C68
`Chr5:16740409`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C26
`Chr5:16740409`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C26
`Chr5:16740991`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B137,B54,C40
`Chr5:16741020`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:16741052`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B14,B64,B91,C5
`Chr5:16741066`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	A5
`Chr5:16741066`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A5
`Chr5:16741104`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B137,B54,C40
`Chr5:16741272`	`ATC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	6	B40,B47,B63,C54,C73,D6
`Chr5:16741430`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A6,B5,B74,C83
`Chr5:16741459`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C31

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765781.1

506 aa

253

506

PMEI

Pectinesterase

PF04043 PMEI 45-162 aa PF01095 Pectinesterase 209-503 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765781.1`	Pfam	`PF04043`	PMEI	Domain	45	162	2.1e-24	87.2	Plant invertase/pectin methylesterase inhibitor
`XP_057765781.1`	Pfam	`PF01095`	Pectinesterase	Repeat	209	503	1.1e-129	432.2	Pectinesterase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909798.1
TTTCTGAGTCTCTACCCCCCCAAATAATTTATCTCATTTACTTAAACTTTTCGATATAAAATGTTAAGAATTATTAGAATTTAAGCTTATTCGGAAGGATAATGATGCAGGAAACAACAAAAATAGCAGGTCTAAACTGAATTTGGTAATATGCCAAACAAGAAAAGCTTGTTTTTAATTGAATTTGGTAACATCACCAAACCTTACTATATACGTTTGGGATGTTACATATGCATTAAATATATAGTCAAAGGTTTGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986402
ATGGGCATGCACAACATGACGACCAAGCCCATTTTTCTTTTGCCTTTGTTATTAATCATCTCAACATATACGATTTCCGCGTCTAACACCTCACTTAATATTCAACTATTCGACAAAACCACCCTAAACGGAAGCCTACACGATCTACTCGACACGAGCCTTGGGGAAACTTTAGCCCAAGCTCAAAATGCTCACCAACTCATTTCAAATATGAATCTAAGCTCCTTCAACGATGATCGAGCCAAAACGGCTTGGAACGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765781.1
MGMHNMTTKPIFLLPLLLIISTYTISASNTSLNIQLFDKTTLNGSLHDLLDTSLGETLAQAQNAHQLISNMNLSSFNDDRAKTAWNDCRYLYQDAIDQLNRSIASINNRLDVQTWLSAVMANQETCQNGFLDFGLPPLSSQSFYLHLTNANMSKFLSNALAINKAISSTSSSAKENRNPRLLANDFPQWVSTGDRILLQSSGNPGKAADIVVAQDGSGSYKNISEGLVKAATMSGTKRIVMYVKRGIYKENVVVDKYLKN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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