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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001735`

染色体: Chr05 坐标: 16756209-16764009 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001735`
名称	SmilChr05G001735
描述	glutamine--tRNA ligase
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	16756209 - 16764009 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986404`
GeneID	`130986404`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986404`
原始查询	`SmilChr05G001735`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glutamine--tRNA ligase
产物	glutamine--tRNA ligase
Arabidopsis	`AT1G25350` (OVA9) glutamine-tRNA ligase, putative / glutaminyl-tRNA synthetase, putative / GlnRS [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839120] identity=78.4; qcov=0.997; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0185200` (P0510F03.13-1) - identity=74.2; qcov=0.999; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004819 (glutamine-tRNA ligase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0005829 (cytosol); GO:0006412 (translation); GO:0006425 (glutaminyl-tRNA aminoacylation)
KEGG	smil00970 (Aminoacyl-tRNA biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00749 (tRNA-synt_1c); PF03950 (tRNA-synt_1c_C); PF04557 (tRNA_synt_1c_R2); PF04558 (tRNA_synt_1c_R1); PF20974 (tRNA-synt_1c_C2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986404

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057765783.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057765783.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057765783.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765783.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765783.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:16759428`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A23,D8
`Chr5:16759887`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr5:16761687`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B73,C21,C31

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765783.1

795 aa

398

795

tRNA_synt_1c_R1

tRNA_synt_1c_R2

tRNA-synt_1c

tRNA-synt_1c_C

tRNA-synt_1c_C2

PF04558 tRNA_synt_1c_R1 13-170 aa PF04557 tRNA_synt_1c_R2 173-246 aa PF00749 tRNA-synt_1c 272-577 aa PF03950 tRNA-synt_1c_C 580-683 aa PF20974 tRNA-synt_1c_C2 693-770 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765783.1`	Pfam	`PF04558`	tRNA_synt_1c_R1	Family	13	170	3.1e-53	180.8	Glutaminyl-tRNA synthetase, non-specific RNA binding region part 1
`XP_057765783.1`	Pfam	`PF04557`	tRNA_synt_1c_R2	Family	173	246	1.4e-07	32.9	Glutaminyl-tRNA synthetase, non-specific RNA binding region part 2
`XP_057765783.1`	Pfam	`PF00749`	tRNA-synt_1c	Domain	272	577	2.5e-123	411.7	tRNA synthetases class I (E and Q), catalytic domain
`XP_057765783.1`	Pfam	`PF03950`	tRNA-synt_1c_C	Domain	580	683	1.2e-19	71.0	tRNA synthetases class I (E and Q), anti-codon binding domain
`XP_057765783.1`	Pfam	`PF20974`	tRNA-synt_1c_C2	Domain	693	770	1.5e-20	74.4	tRNA synthetases class I (E and Q), anti-codon binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909800.1
TTTTTTTGAGAGGGGAAAAATAAATAAAATAAAATTAAGAAGCAAAAATTCCAAATGTCCGCGTTAGGGTTATAATTCCAGGTCATACACTAGCTTAAATATTGAGTATTGACTGACTGTTGAATCCCCCATTATATAATTTCATTGCTAATTGAGAGAAGTTACAGTTGAGCTGAAGCAATGGTAGGGAAAAACGCGACTGAAAGCGGCGGCGACGAGGCACTGGATTTGTTTCTGAAGATTGGGCTTGATGAAAGGAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986404
ATGGTAGGGAAAAACGCGACTGAAAGCGGCGGCGACGAGGCACTGGATTTGTTTCTGAAGATTGGGCTTGATGAAAGGACGGCGAAGAACACCGTCGCTAACAATAAGGTCACGGCGAATCTCACCGCCGTCATTCACGAGGCAGCTGTGACTGATGGATGTGATCGGACAGTTGGAAATCTACTTTACACGGTTGCTACAAAGTTCCCTACAAATGCGCTTGCACATCGGCCTACATTGCTTAAACATATTACTTCATC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765783.1
MVGKNATESGGDEALDLFLKIGLDERTAKNTVANNKVTANLTAVIHEAAVTDGCDRTVGNLLYTVATKFPTNALAHRPTLLKHITSSKIKTPAQLEAAFLFLTTIASDNLKIDEFDAACGVGIEVSEEDIEHAADEIFEENKAVILEQRYRTNVGELFAHVRKKQPWADPKVVKKIIDTKLYALLGERTAADNEKPVKKKKEKPVKAEEKAVVEETAPEKPTEEDINPFLIFPSPDQNFKVHTEIYFSDRPVLRACNSKE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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