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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001741`

染色体: Chr05 坐标: 16878099-16883482 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001741`
名称	SmilChr05G001741
描述	uncharacterized SmilChr05G001741
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	16878099 - 16883482 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986411`
GeneID	`130986411`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986411`
原始查询	`SmilChr05G001741`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Metallo-hydrolase/oxidoreductase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839123]; symbol=AT1G25375; hit=AT1G25375; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Metallo-hydrolase/oxidoreductase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839123]; symbol=AT1G25375; hit=AT1G25375; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G25375` (AT1G25375) Metallo-hydrolase/oxidoreductase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839123] identity=55.6; qcov=0.971; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0133500` (OSJNBa0083M16.21-2) - identity=52.2; qcov=0.996; evalue=1.68e-158; confidence=high
GO	GO:0009536 (plastid)
KEGG	-
Pfam	PF00753 (Lactamase_B); PF17778 (WHD_BLACT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986411

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	0.80000	`XP_057765795.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057765796.1`
3	Peroxisome	过氧化物酶体	0.80000	`XP_057765796.1`
4	Mitochondrion outer membrane	线粒体外膜	0.20000	`XP_057765795.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057765796.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:16879994`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B37
`Chr5:16879995`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,A15,A3,B71,B75
`Chr5:16880049`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B135,C16
`Chr5:16880512`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A10,B132
`Chr5:16880677`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B135,C16

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765795.1

528 aa

264

528

Lactamase_B

WHD_BLACT

PF00753 Lactamase_B 236-394 aa PF17778 WHD_BLACT 429-465 aa

XP_057765796.1

489 aa

244

489

Lactamase_B

WHD_BLACT

PF00753 Lactamase_B 236-394 aa PF17778 WHD_BLACT 429-465 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765795.1`	Pfam	`PF00753`	Lactamase_B	Domain	236	394	1.7e-10	41.9	Metallo-beta-lactamase superfamily
`XP_057765795.1`	Pfam	`PF17778`	WHD_BLACT	Domain	429	465	3.1e-06	27.8	Beta-lactamase associated winged helix domain
`XP_057765796.1`	Pfam	`PF00753`	Lactamase_B	Domain	236	394	1.4e-10	42.1	Metallo-beta-lactamase superfamily
`XP_057765796.1`	Pfam	`PF17778`	WHD_BLACT	Domain	429	465	3.2e-06	27.7	Beta-lactamase associated winged helix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909812.1
AACCAACCACAGCAGCTACAAGTTGAGATTTCTTCATTTCCGCAAATAGGAGTAATTAATTTCATAAATACTTTATAACCAAACAAACCCCTTTCAGTTTAAACAGGACGCGGCATCTCAGTTTCTCACATCCTCAAGCAAAACAGCTATGAGCACGCAGAGACAGAGTGTGAATTTGGCAGTGATCATCAAGAATCCACTACACAACGCCCAATTCCTGCTCACCAAGCAAACCCTACCTCCCAAATTCAACGACACTG...

XM_057909813.1
AACCAACCACAGCAGCTACAAGTTGAGATTTCTTCATTTCCGCAAATAGGAGTAATTAATTTCATAAATACTTTATAACCAAACAAACCCCTTTCAGTTTAAACAGGACGCGGCATCTCAGTTTCTCACATCCTCAAGCAAAACAGCTATGAGCACGCAGAGACAGAGTGTGAATTTGGCAGTGATCATCAAGAATCCACTACACAACGCCCAATTCCTGCTCACCAAGCAAACCCTACCTCCCAAATTCAACGACACTG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130986411
ATGAGCACGCAGAGACAGAGTGTGAATTTGGCAGTGATCATCAAGAATCCACTACACAACGCCCAATTCCTGCTCACCAAGCAAACCCTACCTCCCAAATTCAACGACACTGAGTATGATTCCTATCAAGATTCTGATCTTTGGGACTTGCCCTCTGCACAATTATCACTTCTTGATCGCTCGTTGACTCCTAGTCAAGCTCAATTTCAAGTTGAGGACAATTCTCTGGCCGAATTGTTGCATCAGTTTGATGTCGGCTC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057765795.1
MSTQRQSVNLAVIIKNPLHNAQFLLTKQTLPPKFNDTEYDSYQDSDLWDLPSAQLSLLDRSLTPSQAQFQVEDNSLAELLHQFDVGSATDLVLRRVGYEKTTNIKWNLLKVIEEPEFGPGVPVMTLYIVGELEVHDWKLQDCYKWMSTQSCADLLLEVKPQNERIGPLVVSGLLNDSLQSTNLHIPSTLRCQEYPPGVNLVPMKSRTAKPFHTTNLIIFVPGTSDNDFGGDNFLARGDALIVDPGCSSGMHKELEQIVAA...

XP_057765796.1
MSTQRQSVNLAVIIKNPLHNAQFLLTKQTLPPKFNDTEYDSYQDSDLWDLPSAQLSLLDRSLTPSQAQFQVEDNSLAELLHQFDVGSATDLVLRRVGYEKTTNIKWNLLKVIEEPEFGPGVPVMTLYIVGELEVHDWKLQDCYKWMSTQSCADLLLEVKPQNERIGPLVVSGLLNDSLQSTNLHIPSTLRCQEYPPGVNLVPMKSRTAKPFHTTNLIIFVPGTSDNDFGGDNFLARGDALIVDPGCSSGMHKELEQIVAA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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