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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001748`

染色体: Chr05 坐标: 17022946-17025027 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001748`
名称	SmilChr05G001748
描述	LEAF RUST 10 DISEASE-RESISTANCE LOCUS RECEPTOR-LIKE PROTEIN KINASE-like 2.4
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	17022946 - 17025027 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986431`
GeneID	`130986431`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986431`
原始查询	`SmilChr05G001748`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	LEAF RUST 10 DISEASE-RESISTANCE LOCUS RECEPTOR-LIKE PROTEIN KINASE-like 2.4
产物	LEAF RUST 10 DISEASE-RESISTANCE LOCUS RECEPTOR-LIKE PROTEIN KINASE-like 2.4
Arabidopsis	`AT1G70250` (AT1G70250) receptor serine/threonine kinase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843361] identity=59.3; qcov=0.981; evalue=8.08e-130; confidence=high
Rice	`Os04g0177000` (OsRLCK132) - identity=58.4; qcov=0.954; evalue=2.11e-130; confidence=high
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986431

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057765820.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057765820.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057765820.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765820.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765820.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:17024160`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:17024209`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C38,D5
`Chr5:17024238`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B62,C14,C45,C70
`Chr5:17024273`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B59,C45,C47
`Chr5:17024324`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C73,C75
`Chr5:17024623`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B62,C39,C45
`Chr5:17024651`	`A`	`AGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	B89,C39,C45
`Chr5:17024651`	`A`	`AGT`	2bp_insertion	CDS_variant	3	B89,C39,C45
`Chr5:17024745`	`CAA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C75
`Chr5:17024745`	`CAA`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C75
`Chr5:17024764`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,A18,C83
`Chr5:17024844`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765820.1

323 aa

162

323

PK_Tyr_Ser-Thr

Pkinase

PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 15-292 aa PF00069 Pkinase 16-290 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765820.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	15	292	7.5e-44	150.7	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057765820.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	16	290	3.3e-46	158.5	Protein kinase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909837.1
AAGGAATTTTCTAAGGAGCTCAATTGCAGAACCGAAGCTGCTTTACTTTCATGAATCAATCTATGCTTCGATCTCCTTCTATTTCAATCTCATTCTCTCCTAATCTCACTTTGTTCCCCTGCTTCTCCGATCCTGCTACTAACAAATCTAAATTAGATGAACATTTCAAAAACTATAGCAAGATAGATTGTATCTCCACCGTATACTATAAAATTCCAACAGCCGATGACTCTGCTTCCGAGAAAATTGAAATTCCTCGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986431
ATGAGATACAAATACTCTAGTATCAAGAAAATGACAAACTCATTTACTGAAAACTTGGGAAGAGGAGGGTTTGGCAGTGTCTACAAAGGACACTTTCCCGATGGTCATCTTGTGGCAGTGAAGGTCTTGAATGAATCTAATGAAAATGGGGAAGATTTCATGAATGAGGTTGCCAGTATTAGCAGAACTTCCCATATTAATATTGTCACGCTTTTAGGATTTTGTTTTGAAGGTTCTAAAAGAGCTCTCATTTATGATTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765820.1
MRYKYSSIKKMTNSFTENLGRGGFGSVYKGHFPDGHLVAVKVLNESNENGEDFMNEVASISRTSHINIVTLLGFCFEGSKRALIYDFMPNGSLEKFVCNNAPSSAESRLEWDKLFEIALGIARGLEYLHQGCNTRILHLDIKPQNILLDKDMNPRISDFGLAKLCPNRSSIVSIMVARGTIGYIAPEVFSRNFGEVSYKCDVYSYGMLVLEMVGGRRNIDRREVDRTSEIYFPHYLYKQVEMNAERHGNLAGNFNEEDES...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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