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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001755`

染色体: Chr05 坐标: 17127067-17129295 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001755`
名称	SmilChr05G001755
描述	F-box protein At2g32560-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	17127067 - 17129295 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986438`
GeneID	`130986438`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986438`
原始查询	`SmilChr05G001755`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box protein At2g32560-like
产物	F-box protein At2g32560-like
Arabidopsis	`AT2G32560` (AT2G32560) F-box family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817817] identity=72.4; qcov=0.682; evalue=3.43e-26; confidence=medium
Rice	`Os01g0281000` (OsFbox006) - identity=71.7; qcov=0.624; evalue=7.24e-24; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986438

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057765825.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057765828.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057765827.1`
4	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057765827.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765825.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:17128503`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B103
`Chr5:17128525`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B131,B77,C19,C40
`Chr5:17128525`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B131,B77,C19,C40
`Chr5:17128536`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B12
`Chr5:17128536`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr5:17128547`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B22,B3,C41,C84,D7
`Chr5:17128701`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B41,B44,B82,B90,B99
`Chr5:17128831`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B128,B31,C4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

7 records

下载 cDNA FASTA

XR_009089264.1
TCCCACCCATTCTGCCATTCATCCCCCATTCCCCACCCACACCCGCCGCCCCGAGGCCCCTGCCGGCGCCGCCCTCTGCGCCTCCCCTCCCTCACATCCTCGCTCGCAGTCGCAGACTTGGAGCCCTCTGCCGACGCTGCTTCTCTGCGCCGAGCCGCCCTCCGCGCCTCCCCTCCCCTCCTCGCTCCCCAGGTCCCAGGCTCCCAGCCGCGTCGTGACACCATTGCTTAGGCCCAGCCGACCCTCGACGTCGCCCAAGC...

XR_009089263.1
TCCCACCCATTCTGCCATTCATCCCCCATTCCCCACCCACACCCGCCGCCCCGAGGCCCCTGCCGGCGCCGCCCTCTGCGCCTCCCCTCCCTCACATCCTCGCTCGCAGTCGCAGACTTGGAGCCCTCTGCCGACGCTGCTTCTCTGCGCCGAGCCGCCCTCCGCGCCTCCCCTCCCCTCCTCGCTCCCCAGGTCCCAGGCTCCCAGCCGCGTCGTGACACCATTGCTTAGGCCCAGCCGACCCTCGACGTCGCCCAAGC...

CDS

5 records

下载 CDS FASTA

LOC130986438
ATGAAGGATAAAAAAAATACTTCTTTACCACATAACTCACTCATGTCTTGCTATCTCGCTCTTCAAAGTGGAAAATTCTGGTTTCCAGCTCAGGTTTTCAACAGAGAGGTAAATTGGAATGGGCATGTGGGATTTATGCTTTCGTGTTATGACGCACAATTAAGCTATGGTTCAACCTCAGACAATTTTGTTGCTAGATATAAAAACCTTATATACAAGAATCTCCTAAGTAAGTCTATTTACATCCACCTACTTTGTAC...

Protein

5 records

下载 Protein FASTA

XP_057765825.1
MKDKKNTSLPHNSLMSCYLALQSGKFWFPAQVFNREVNWNGHVGFMLSCYDAQLSYGSTSDNFVARYKNLIYKNLLSKSIYIHLLCTLAVHGSIERC

XP_057765826.1
MKDKKNTSLPHNSLMSCYLALQSGKFWFPAQVFNREVNWNGHVGFMLSCYDAQLSYGSTSDNFVARYKNLIYKNLLSKSIYIHLLCTLAVHGSIERC

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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