当前解析结果
SmilChr05G001757| 统一新 Gene ID | SmilChr05G001757 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G001757 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr05G001757 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 17280640 - 17282124 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131025581 |
|---|---|
| GeneID | 131025581 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131025581 |
| 原始查询 | SmilChr05G001757 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=medium |
| 产物 | hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=medium |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os06g0523701- identity=35; qcov=0.508; evalue=1.52e-39; confidence=medium |
| GO | GO:0003676 (nucleic acid binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131025581 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057811364.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.20000 | XP_057811364.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057811364.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057811364.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057811364.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:17280674 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B35 |
Chr5:17280684 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A24,B82,C71 |
Chr5:17280742 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A24,B82 |
Chr5:17280751 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A23,B115 |
Chr5:17280781 |
TC |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 9 | B1,B11,B115,B138,C38,C61,C69,C7,C85 |
Chr5:17280784 |
G |
GA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 9 | B1,B11,B115,B138,C38,C61,C69,C7,C85 |
Chr5:17280787 |
A |
ACT |
2bp_insertion | frameshift_variant | 10 | B1,B11,B115,B138,C38,C61,C69,C7,C71,C85 |
Chr5:17280789 |
TCC |
T |
2bp_deletion | frameshift_variant | 11 | B1,B11,B115,B138,C38,C61,C69,C7,C71,C78,C85 |
Chr5:17280804 |
CT |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 16 | A6,B112,B28,B31,B75,B78,B87,C14,C20,C29,C41,C46,C52,C6,C63,D1 |
Chr5:17280961 |
CA |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 4 | B125,B28,C14,C46 |
Chr5:17280961 |
CA |
C |
1bp_deletion | CDS_variant | 4 | B125,B28,C14,C46 |
Chr5:17281027 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B1,B92 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。