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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001780`

染色体: Chr05 坐标: 17527514-17529315 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001780`
名称	SmilChr05G001780
描述	uncharacterized protein C24B11.05
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	17527514 - 17529315 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986468`
GeneID	`130986468`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986468`
原始查询	`SmilChr05G001780`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	OsHAD1; symbol=OsHAD1; hit=Os03g0834050; species=rice; confidence=high
产物	OsHAD1; symbol=OsHAD1; hit=Os03g0834050; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G62040` (AT3G62040) Haloacid dehalogenase-like hydrolase (HAD) superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825377] identity=71.2; qcov=0.867; evalue=4.24e-109; confidence=high
Rice	`Os03g0834050` (OsHAD1) - identity=63.7; qcov=1.07; evalue=1.9e-121; confidence=high
GO	-
KEGG	smil00760 (Nicotinate and nicotinamide metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00702 (Hydrolase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986468

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057765879.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057765879.1`
3	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057765879.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765879.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765879.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:17527664`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:17527719`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C22,D9
`Chr5:17528189`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A16,A5,B101,B70,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765879.1

266 aa

133

266

Hydrolase

PF00702 Hydrolase 12-211 aa

XP_057765880.1

266 aa

133

266

Hydrolase

PF00702 Hydrolase 12-211 aa

XP_057765881.1

256 aa

128

256

Hydrolase

PF00702 Hydrolase 12-201 aa

XP_057765882.1

256 aa

128

256

Hydrolase

PF00702 Hydrolase 12-201 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765879.1`	Pfam	`PF00702`	Hydrolase	Domain	12	211	2.7e-12	48.2	haloacid dehalogenase-like hydrolase
`XP_057765880.1`	Pfam	`PF00702`	Hydrolase	Domain	12	211	2.7e-12	48.2	haloacid dehalogenase-like hydrolase
`XP_057765881.1`	Pfam	`PF00702`	Hydrolase	Domain	12	201	2.3e-12	48.5	haloacid dehalogenase-like hydrolase
`XP_057765882.1`	Pfam	`PF00702`	Hydrolase	Domain	12	201	2.3e-12	48.5	haloacid dehalogenase-like hydrolase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909899.1
CTCCATTATCAAAACATGATCTCATTCTCCTCAATTATAAATATGTGATCATAATCCATTGTGCAATAAACTAAGAGCCTCTTTTCAAAAATCAAACTTAGTTCAAGGTTGTGATTTTAGTCTTACTGAAATGGAAGCTGGAAGGTCTAATGGTCCTAAATATGAGTGCTTGCTCTTCGATATGGATGACACTCTATACCCTTTGAGTTTGGGGATCAATATGGCTTGTCGCAAGAATATAGAAGAAAGTGAGGTCCCTA...

XM_057909896.1
CTCCATTATCAAAACATGATCTCATTCTCCTCAATTATAAATATGTGATCATAATCCATTGTGCAATAAACTAAGAGCCTCTTTTCAAAAATCAAACTTAGTTCAAGGTTGTGATTTTAGTCTTACTGAAATGGAAGCTGGAAGGTCTAATGGTCCTAAATATGAGTGCTTGCTCTTCGATATGGATGACACTCTATACCCTTTGAGTTTGGGGATCAATATGGCTTGTCGCAAGAATATAGAAGAGTATATGCTGCATC...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC130986468
ATGGAAGCTGGAAGGTCTAATGGTCCTAAATATGAGTGCTTGCTCTTCGATATGGATGACACTCTATACCCTTTGAGTTTGGGGATCAATATGGCTTGTCGCAAGAATATAGAAGAAAGTGAGGTCCCTAGGCTGTGCTTAGAGTTGTACAAAGACTATGGGACGACAATGGCTGGCCTCAAGGTGATGGGGTACGAATTTGACAATGATGAGTTTCATGCTTATGTTCATGGAAGGTTGCCGTATGAGTTGCTACAGCC...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057765879.1
MEAGRSNGPKYECLLFDMDDTLYPLSLGINMACRKNIEEYMLHHMHIEESEVPRLCLELYKDYGTTMAGLKVMGYEFDNDEFHAYVHGRLPYELLQPDPVLRNLLHSMPQHKIIFTNADKAHVAQVLSRMGLEDCFHGVICFETLNPPLKSMDGTVEAQMSNGNLSRKTQILCKPSVEAMEAAIRIANVDPNKTIFFDDSIRNIVSGKAAGLHTVVVGRSTLVPGADHALNSIHNIKEALPEIWEDEVEHLEQIIQSSAV...

XP_057765880.1
MEAGRSNGPKYECLLFDMDDTLYPLSLGINMACRKNIEEYMLHHMHIEESEVPRLCLELYKDYGTTMAGLKVMGYEFDNDEFHAYVHGRLPYELLQPDPVLRNLLHSMPQHKIIFTNADKAHVAQVLSRMGLEDCFHGVICFETLNPPLKSMDGTVEAQMSNGNLSRKTQILCKPSVEAMEAAIRIANVDPNKTIFFDDSIRNIVSGKAAGLHTVVVGRSTLVPGADHALNSIHNIKEALPEIWEDEVEHLEQIIQSSAV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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