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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001819`

染色体: Chr05 坐标: 18210290-18213372 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001819`
名称	SmilChr05G001819
描述	auxin efflux carrier component 3-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	18210290 - 18213372 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986491`
GeneID	`130986491`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986491`
原始查询	`SmilChr05G001819`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	auxin efflux carrier component 3-like
产物	auxin efflux carrier component 3-like
Arabidopsis	`AT1G70940` (PIN3) Auxin efflux carrier family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843432] identity=72; qcov=1.08; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0743400` (PIN1A) auxin efflux carrier component 1a-like [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:4330700] identity=60.8; qcov=1.06; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005783 (endoplasmic reticulum); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0009926 (auxin polar transport); GO:0010315 (auxin export across the plasma membrane); GO:0010329 (auxin efflux transmembrane transporter activity)
KEGG	-
Pfam	PF03547 (Mem_trans)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986491

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057765902.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057765902.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765902.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765902.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057765902.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:18210858`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:18210962`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B71,C62
`Chr5:18211191`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	A22,B31
`Chr5:18211191`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	2	A22,B31
`Chr5:18211485`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B42,B43,B73,C31
`Chr5:18211841`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr5:18211957`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B57,C32,C68
`Chr5:18212089`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B42,B43,B73,C31
`Chr5:18212308`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A19,B17,B41,C28
`Chr5:18212611`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr5:18212698`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:18212776`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765902.1

605 aa

302

605

Mem_trans

PF03547 Mem_trans 10-600 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765902.1`	Pfam	`PF03547`	Mem_trans	Family	10	600	1.3e-128	429.1	Membrane transport protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909919.1
AAATGAGAGGTAAGGTAAGAAAAAGTAAACCTGAGCAGTCGAAAACATGATTTCAACCTAAATGGTCAGCAGTTTGATGAGGCACTCAAAATTGCTATTCCCACTCCCCCCTATAAATACATACATCTTCTCCATTTATACACTCCCCCCTATAATTCCTCTCTCTCTCTCTTGTCTGTGTAGTCAGTAACAGTCGAAAACGGCTTCTGCAGTGTAGAGAAAAAAAAAATAAAAAAAATGATAAGCTGGCACGATCTGTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986491
ATGATAAGCTGGCACGATCTGTACGTAGTCCTAACCGCAATGGTTCCCCTGTACGTGGCCATGATCCTGGCGTACGGGTCGGTGCGGTGGTGGAAGATCTTCACGCCGGATCAGTGCTCCGGCATCAACCGTTTCGTGGCGGTGTTCGCGGTGCCGCTGCTGTCGTTCCACTTCATCTCCCGCAACGACATCTACGCGATGAATTTCCGGTTCATTGCGGCGGACAGCCTGCAGAAGGTGATAATGCTGATAGTTCTGGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765902.1
MISWHDLYVVLTAMVPLYVAMILAYGSVRWWKIFTPDQCSGINRFVAVFAVPLLSFHFISRNDIYAMNFRFIAADSLQKVIMLIVLGVWANLTKNGSLEWSITIFSLSTLPNTLVMGIPLLIAMYGEYSGSLMVQLIVLQCIIWYTLLLFLFEYRAAKMLISEQFPETAASIVSFKVDSDVISLDGQDFLQTDAEIGDDGKLHVTVRKSNASNLTGAEIYSLSSSRNPTPRGSNFNHSDFYSMMGMGRLSNFGNSDTGRM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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