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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001835`

染色体: Chr05 坐标: 18381926-18384502 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001835`
名称	SmilChr05G001835
描述	phytanoyl-CoA dioxygenase
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	18381926 - 18384502 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986506`
GeneID	`130986506`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986506`
原始查询	`SmilChr05G001835`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	phytanoyl-CoA dioxygenase
产物	phytanoyl-CoA dioxygenase
Arabidopsis	`AT2G01490` (PAHX) phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814677] identity=74.5; qcov=0.996; evalue=3.38e-159; confidence=high
Rice	`Os03g0708100` (OMT7) - identity=68; qcov=0.993; evalue=3.47e-145; confidence=high
GO	GO:0048244 (phytanoyl-CoA dioxygenase activity)
KEGG	smil04146 (Peroxisome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF05721 (PhyH)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986506

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057765921.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057765922.1`
3	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057765922.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765921.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765921.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:18382149`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B74
`Chr5:18383007`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	A9,B18,B61,B94,B99,C4,C49
`Chr5:18383163`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr5:18383904`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C28
`Chr5:18384212`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	29	A10,A20,A21,B1,B104,B11,B112,B12,B128,B132,B140,B34,B57,B60,B64,B68,B72,B83,B91,C10,C24,C27,C32,C52,C68,C83,C84,C85,C9
`Chr5:18384241`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	37	A14,A16,A9,B119,B123,B126,B133,B135,B35,B42,B43,B6,B73,B75,B79,B81,B87,C1,C12,C17,C20,C24,C27,C30,C35,C4,C46,C53,C57,C61,C64,C66,C67,C71,C82,D11,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765921.1

313 aa

156

313

PhyH

PF05721 PhyH 15-252 aa

XP_057765922.1

283 aa

142

283

PhyH

PF05721 PhyH 15-252 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765921.1`	Pfam	`PF05721`	PhyH	Domain	15	252	1.6e-55	189.4	Phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH)
`XP_057765922.1`	Pfam	`PF05721`	PhyH	Domain	15	252	1.2e-55	189.9	Phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909938.1
TTGCAAAGTAGCACTAGCAGCGTAGGAGATGGGGATTACGCATACTCTTGGTTGGATAAGTTGAAAACCTGAAATTTTGTACGCTCCGCCGAAGAAAAACAAATTCAGTAATTATTGGAGCCTAAACAAAATCAGTTATGGGAATTGCCGGAAACCTGAATCCAAACCAGCTGGAGTTCTTCAACTCTCAAGGTTATCTGGTTTTAGACTCCTTTTCCAGCCCCGATGAGATTAGATCCCTTAGGTCAAGAATGGAGCAA...

XM_057909939.1
GCAAAGTAGCACTAGCAGCGTAGGAGATGGGGATTACGCATACTCTTGGTTGGATAAGTTGAAAACCTGAAATTTTGTACGCTCCGCCGAAGAAAAACAAATTCAGTAATTATTGGAGCCTAAACAAAATCAGTTATGGGAATTGCCGGAAACCTGAATCCAAACCAGCTGGAGTTCTTCAACTCTCAAGGTTATCTGGTTTTAGACTCCTTTTCCAGCCCCGATGAGATTAGATCCCTTAGGTCAAGAATGGAGCAATT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130986506
ATGGGAATTGCCGGAAACCTGAATCCAAACCAGCTGGAGTTCTTCAACTCTCAAGGTTATCTGGTTTTAGACTCCTTTTCCAGCCCCGATGAGATTAGATCCCTTAGGTCAAGAATGGAGCAATTGCTTGATGAATTTGATTGTTCCACCAAAGCTTCCATCTTCTCCACCACCAACCAACAAAAGACGACCGATGATTACTTCTTTGAAAGTGCTGAGAAGATTTCCTTTTTCTTTGAAGAAAAAGCTTTTGATGATGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057765921.1
MGIAGNLNPNQLEFFNSQGYLVLDSFSSPDEIRSLRSRMEQLLDEFDCSTKASIFSTTNQQKTTDDYFFESAEKISFFFEEKAFDDDGILKQPKQLSINKVGHALHDIDPIFKSFSTSEKSTGLLSSLGYKRPVVIQSMYIFKQPGIGGEVVPHQDNSFLYTDPPTCTGLWLALEDATVTNGCLWAIPGSHKAGLVRRFIRDEAGVHFDKPSPSYDQKDFVPIEVNAGALVVIHGDLIHQSFENKSSTSRHAYSLHVVDT...

XP_057765922.1
MGIAGNLNPNQLEFFNSQGYLVLDSFSSPDEIRSLRSRMEQLLDEFDCSTKASIFSTTNQQKTTDDYFFESAEKISFFFEEKAFDDDGILKQPKQLSINKVGHALHDIDPIFKSFSTSEKSTGLLSSLGYKRPVVIQSMYIFKQPGIGGEVVPHQDNSFLYTDPPTCTGLWLALEDATVTNGCLWAIPGSHKAGLVRRFIRDEAGVHFDKPSPSYDQKDFVPIEVNAGALVVIHGDLIHQSFENKSSTSRHAYSLHVVDT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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