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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001842`

染色体: Chr05 坐标: 18472427-18473079 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001842`
名称	SmilChr05G001842
描述	uncharacterized SmilChr05G001842
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	18472427 - 18473079 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025599`
GeneID	`131025599`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025599`
原始查询	`SmilChr05G001842`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=33.1; qcov=0.837; evalue=9e-19; confidence=low
Rice	`Os06g0597250` - identity=39.1; qcov=0.875; evalue=2.51e-30; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF28509 (DUF8418)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025599

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057811381.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057811381.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811381.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057811381.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057811381.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:18472435`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr5:18472442`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C84
`Chr5:18472450`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	8	B21,B60,B73,C11,C13,C37,C39,C63
`Chr5:18472452`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr5:18472454`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B117
`Chr5:18472470`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,B107,B132,B66,C53
`Chr5:18472602`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C40
`Chr5:18472623`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	24	A24,A25,A5,B103,B106,B119,B130,B139,B23,B25,B45,B57,B63,B70,B90,B92,B95,C10,C63,C65,C74,C75,C82,D4
`Chr5:18472638`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	59	A11,A13,A14,A15,A20,A3,B103,B106,B109,B113,B115,B117,B118,B134,B136,B15,B18,B2,B21,B26,B27,B30,B36,B56,B58,B60,B64,B65,B69,B7,B78,B80,B9,B96,B97,C15,C18,C23,C29,C34,C35,C36,C37,C39,C43,C50,C56,C59,C6,C65,C70,C72,C83,C84,C86,D2,D5,D6,D7
`Chr5:18472641`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C20
`Chr5:18472694`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B113,B117,B126
`Chr5:18472736`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B117,B126,C71

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811381.1

184 aa

184

DUF8418

PF28509 DUF8418 58-95 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811381.1`	Pfam	`PF28509`	DUF8418	Domain	58	95	1.4e-15	57.4	Domain of unknown function (DUF8418)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955398.1
ATGCCCGAATGGTTCGATGATACTTCGTCGTCTGAATCCGACAGGGTAGCTCAAGAGATCATTGATGAGATCCAGTTGCAGAAACAATTGATTGCTCAAATATACTCCCAACCGGAACCGGAACGTATTGTTTATCACCGATCTTACGTCTACCGTGATCGTGAGGCTGCTCATTTACGTCTTATGCAAGACTACTTCAATGACAATCAAACGTACGGGCCTACATTTTTCCGACGTCGTTTTCGGAAGCAGAAGGAGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025599
ATGCCCGAATGGTTCGATGATACTTCGTCGTCTGAATCCGACAGGGTAGCTCAAGAGATCATTGATGAGATCCAGTTGCAGAAACAATTGATTGCTCAAATATACTCCCAACCGGAACCGGAACGTATTGTTTATCACCGATCTTACGTCTACCGTGATCGTGAGGCTGCTCATTTACGTCTTATGCAAGACTACTTCAATGACAATCAAACGTACGGGCCTACATTTTTCCGACGTCGTTTTCGGAAGCAGAAGGAGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811381.1
MPEWFDDTSSSESDRVAQEIIDEIQLQKQLIAQIYSQPEPERIVYHRSYVYRDREAAHLRLMQDYFNDNQTYGPTFFRRRFRKQKELFLRIIDAMQDEDSYFQMSYDARGRDSLTSLQKYTVAIRKLATSVSVDTFDEYLKVADTRGRLCLKRFCKAVIRAYGARIVQRRGMAHIYAVIKGSPP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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