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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001855`

染色体: Chr05 坐标: 18580433-18581610 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001855`
名称	SmilChr05G001855
描述	uncharacterized SmilChr05G001855
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	18580433 - 18581610 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025602`
GeneID	`131025602`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025602`
原始查询	`SmilChr05G001855`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os09g0545250; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os09g0545250; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G24255` (AT3G24255) RNA-directed DNA polymerase (reverse transcriptase)-related family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822013] identity=29.7; qcov=0.599; evalue=1.09e-11; confidence=low
Rice	`Os09g0545250` - identity=41.3; qcov=0.47; evalue=6.61e-35; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025602

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057811385.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057811385.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057811385.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811385.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811385.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:18580435`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B33,C2,D1
`Chr5:18580436`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B131,C28,C34,D7
`Chr5:18580448`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr5:18580454`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B12,B4,C27,C61,C9
`Chr5:18580481`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A24,B1,B120,B73,C1
`Chr5:18580502`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A4,B17,B41,B8
`Chr5:18580504`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,C2,D1
`Chr5:18580546`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,C34,D7
`Chr5:18580630`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D1
`Chr5:18580654`	`ATT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	8	A11,A24,A25,B139,B23,B45,C10,C63
`Chr5:18580734`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr5:18580752`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B128,B37,C60

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955402.1
ATGGTACATGGAAATGACCCACCACAAACTCCGGAGATTCATTCCAAACATGAAGTAAAGAAATATCTTGTGCCGCTTTCGCTAAATCATGAAATCTGTTTAAAGGATGATTGCCTCTTCTTTTGTCGTGACTCTCCTGCTGAATGTGCCAGTTTAAAGAATGTTCTCAGGGTGTATGAATTGGCTTCCGGTCAGGCGATTAACAATCAGAAATCTGGCATATTTTATAGTTCCAATGTTCATCAAGGTGACCGTGAGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025602
ATGGTACATGGAAATGACCCACCACAAACTCCGGAGATTCATTCCAAACATGAAGTAAAGAAATATCTTGTGCCGCTTTCGCTAAATCATGAAATCTGTTTAAAGGATGATTGCCTCTTCTTTTGTCGTGACTCTCCTGCTGAATGTGCCAGTTTAAAGAATGTTCTCAGGGTGTATGAATTGGCTTCCGGTCAGGCGATTAACAATCAGAAATCTGGCATATTTTATAGTTCCAATGTTCATCAAGGTGACCGTGAGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811385.1
MVHGNDPPQTPEIHSKHEVKKYLVPLSLNHEICLKDDCLFFCRDSPAECASLKNVLRVYELASGQAINNQKSGIFYSSNVHQGDRELLSNILGVSVPLNTGRYLGLPSLLGRKKREISFLRERVWSCIQCWNGNKLSKAGKEILIKGVAQTIPSYTMAIYALPISLTDELERLMNSFWWGHKAGTGKGIKWMKWERLCVDKALGGMGPSFSWRSIMSAQDLVKRGVRWHIGDGSRWDSTYVKHIVGEEEATHILGVPIFS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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