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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001859`

染色体: Chr05 坐标: 18617954-18621907 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001859`
名称	SmilChr05G001859
描述	probable inactive heme oxygenase 2, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	18617954 - 18621907 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986527`
GeneID	`130986527`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986527`
原始查询	`SmilChr05G001859`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable inactive heme oxygenase 2, chloroplastic
产物	probable inactive heme oxygenase 2%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT2G26550` (HO2) heme oxygenase 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817196] identity=62.7; qcov=0.748; evalue=2.35e-104; confidence=high
Rice	`Os03g0395000` (OsHO2) - identity=51.1; qcov=0.772; evalue=1.5e-87; confidence=high
GO	GO:0004392 (heme oxygenase (decyclizing) activity); GO:0006788 (heme oxidation); GO:0010024 (phytochromobilin biosynthetic process)
KEGG	-
Pfam	PF01126 (Heme_oxygenase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986527

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057765941.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057765941.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057765941.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765941.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765941.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:18621146`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr5:18621414`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr5:18621438`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A22,B124,B36,B66,C63
`Chr5:18621535`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B2
`Chr5:18621698`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr5:18621702`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	28	A10,A20,B1,B105,B127,B137,B16,B18,B44,B47,B54,B59,B62,B72,B97,C12,C24,C30,C31,C33,C40,C44,C45,C47,C67,C83,C87,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765941.1

337 aa

168

337

Heme_oxygenase

PF01126 Heme_oxygenase 171-333 aa

XP_057765942.1

337 aa

168

337

Heme_oxygenase

PF01126 Heme_oxygenase 171-333 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765941.1`	Pfam	`PF01126`	Heme_oxygenase	Domain	171	333	5e-12	46.8	Heme oxygenase
`XP_057765942.1`	Pfam	`PF01126`	Heme_oxygenase	Domain	171	333	5e-12	46.8	Heme oxygenase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XR_009089297.1
GTTTTATACATTCAATGGTGCTCACGTTTTCACGGCTACAATGTTTTTGCCGAGCTTCGTTCTTCCGAATTGGCTCTATACCCAAGGCGAACTCTCTGTGGAACCAAAATATTTGCTCGTGTAAAAAATTTTGAGTCGGCCGATTTCTTCCTGAACCGTAACATAAATACGTTTAAATCAAATCGATCGAAAATTTGATGAGTGCAAAAATGGCCTACTTTCCCAGTCTAAACCCTTCAGCATCATTGAATTTCATCAAA...

XM_057909958.1
ACAAAAGTTTTATACATTCAATGGTGCTCACGTTTTCACGGCTACAATGTTTTTGCCGAGCTTCGTTCTTCCGAATTGGCTCTATACCCAAGGCGAACTCTCTGTGGAACCAAAATATTTGCTCGTGTAAAAAATTTTGAGTCGGCCGATTTCTTCCTGAACCGTAACATAAATACGTTTAAATCAAATCGATCGAAAATTTGATGAGTGCAAAAATGGCCTACTTTCCCAGTCTAAACCCTTCAGCATCATTGAATTTC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130986527
ATGAGTGCAAAAATGGCCTACTTTCCCAGTCTAAACCCTTCAGCATCATTGAATTTCATCAAAACCAGAAGCCCGCGGTTGTTCGTGAAATCCTATCTTGCACCCACGATGAACGCTGAAAAGATCTTAAGAAATGGCAGACTCCAACGTAACCCTTTTGTCTTGCAATGCACAAAATTCAGCGCGCTCGCCTCAGCGTCAGAAACAGAGAGCGACTATGAAACGGAGGAAGTTGAAGAATACTCGGACGAGGAAGAAGG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057765941.1
MSAKMAYFPSLNPSASLNFIKTRSPRLFVKSYLAPTMNAEKILRNGRLQRNPFVLQCTKFSALASASETESDYETEEVEEYSDEEEGPPPNGQTPSPVKRRRRRYRKQYPGEVNGITEEMRFVAMKLRNNGKPKSRRASSVGSKRDGEDLEIESEKGGNNGEAWQPSIEGFMKYLVDTKLVFTTVERIVDESTDVSYVYFRRTGLERADRISRDLEWLREQGNEIPEPSNPGATYVQHLEELAEKSPPLFLCHFYNIYFS...

XP_057765942.1
MSAKMAYFPSLNPSASLNFIKTRSPRLFVKSYLAPTMNAEKILRNGRLQRNPFVLQCTKFSALASASETESDYETEEVEEYSDEEEGPPPNGQTPSPVKRRRRRYRKQYPGEVNGITEEMRFVAMKLRNNGKPKSRRASSVGSKRDGEDLEIESEKGGNNGEAWQPSIEGFMKYLVDTKLVFTTVERIVDESTDVSYVYFRRTGLERADRISRDLEWLREQGNEIPEPSNPGATYVQHLEELAEKSPPLFLCHFYNIYFS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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