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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001869`

染色体: Chr05 坐标: 18842474-18847825 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001869`
名称	SmilChr05G001869
描述	protein TUNICAMYCIN INDUCED 1
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	18842474 - 18847825 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986535`
GeneID	`130986535`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986535`
原始查询	`SmilChr05G001869`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein TUNICAMYCIN INDUCED 1
产物	protein TUNICAMYCIN INDUCED 1
Arabidopsis	`AT1G47310` (AT1G47310) signal peptidase I [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841134] identity=35.2; qcov=0.974; evalue=4.24e-49; confidence=medium
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF28340 (TIN1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986535

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057765950.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.60000	`XP_057765950.1`
3	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.40000	`XP_057765950.1`
4	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	0.20000	`XP_057765950.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057765950.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:18842951`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B79
`Chr5:18843040`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr5:18843295`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,B101,B70
`Chr5:18843361`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr5:18843413`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr5:18846977`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C61,C74,D11
`Chr5:18847532`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B128
`Chr5:18847568`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B75,C20
`Chr5:18847627`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B94
`Chr5:18847627`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B94
`Chr5:18847644`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765950.1

413 aa

206

413

TIN1

PF28340 TIN1 87-398 aa

XP_057765951.1

312 aa

156

312

TIN1

PF28340 TIN1 87-266 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765950.1`	Pfam	`PF28340`	TIN1	Family	87	398	7e-59	200.7	TIN1
`XP_057765951.1`	Pfam	`PF28340`	TIN1	Family	87	266	1.1e-29	104.7	TIN1

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909967.1
ATCATCATCAACATAATCTTTTCACGGAGTTTGTGCTTTTCTAGTACTCCTCGGTGCCCAAACTGCAGATTATTAACAACCGTCGTTGCCGACAGTCGCCTGCCATCATCTGTCATCAGTAAACACTGAATAATTTTTGAATCGACATTCTGTTACGGCTCAGATAAAAATTCGATGATTGCCCAAAATTCAACGCCATTTTTGCTGACAATTTTCCTTTCCCTTGTGTTGATACACTCGGCAATCATTCCGCCGCGGCC...

XM_057909968.1
AACATAATCTTTTCACGGAGTTTGTGCTTTTCTAGTACTCCTCGGTGCCCAAACTGCAGATTATTAACAACCGTCGTTGCCGACAGTCGCCTGCCATCATCTGTCATCAGTAAACACTGAATAATTTTTGAATCGACATTCTGTTACGGCTCAGATAAAAATTCGATGATTGCCCAAAATTCAACGCCATTTTTGCTGACAATTTTCCTTTCCCTTGTGTTGATACACTCGGCAATCATTCCGCCGCGGCCTTTCAACCT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130986535
ATGATTGCCCAAAATTCAACGCCATTTTTGCTGACAATTTTCCTTTCCCTTGTGTTGATACACTCGGCAATCATTCCGCCGCGGCCTTTCAACCTTTCCCACTTTCTCTATCCAAAAGTCACGGCCTTCACTGAATCGGACATTCCTCTCCAGCCGCCGCAGTTTTTACAGGGTGTTTTGGATTCGATTGCTAAGAAAGAGAAATGGGCTTTGGAGGACTTTTGGGTTTCAGAATTGGATGTAAAGAAAGCTAAGTACAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057765950.1
MIAQNSTPFLLTIFLSLVLIHSAIIPPRPFNLSHFLYPKVTAFTESDIPLQPPQFLQGVLDSIAKKEKWALEDFWVSELDVKKAKYKTVQRYDFRVRVGKIEVALKMHDETSEWKKLGGSRENELLNFEALARRIGSTAVIDSFKAEGPLELMVIGEDDRLSLELPLNSSHFGLQRISVGKGISVEVKGAEEISVFHPSDYQFLYRMFSYRRWSGLGSIWPALCTRLLPIRIIGSASVTAYRSKRPGALIQTSSRSTDAI...

XP_057765951.1
MIAQNSTPFLLTIFLSLVLIHSAIIPPRPFNLSHFLYPKVTAFTESDIPLQPPQFLQGVLDSIAKKEKWALEDFWVSELDVKKAKYKTVQRYDFRVRVGKIEVALKMHDETSEWKKLGGSRENELLNFEALARRIGSTAVIDSFKAEGPLELMVIGEDDRLSLELPLNSSHFGLQRISVGKGISVEVKGAEEISVFHPSDYQFLYRMFSYRRWSGLGSIWPALCTRLLPIRIIGSASVTAYRSKRPGALIQTSSRSTDAI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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