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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001874`

染色体: Chr05 坐标: 18959891-18961462 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001874`
名称	SmilChr05G001874
描述	protein JINGUBANG-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	18959891 - 18961462 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986540`
GeneID	`130986540`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986540`
原始查询	`SmilChr05G001874`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein JINGUBANG-like
产物	protein JINGUBANG-like
Arabidopsis	`AT2G26490` (AT2G26490) Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817190] identity=55.5; qcov=1.06; evalue=5.98e-153; confidence=high
Rice	`Os03g0738700` (OsWD40-89) - identity=53.7; qcov=1.01; evalue=5.47e-134; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00400 (WD40)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986540

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057765963.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057765963.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057765963.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765963.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765963.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:18960148`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	9	B100,B109,B114,B127,B14,B34,B37,C41,C49
`Chr5:18960165`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,A5,B50,C82
`Chr5:18960203`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B134
`Chr5:18960253`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr5:18960255`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:18960272`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B104,B134
`Chr5:18960294`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B40,C30,C78
`Chr5:18960306`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B64,C34,C57
`Chr5:18960354`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B87
`Chr5:18960362`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B54,B94,B98
`Chr5:18960366`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A8,B35
`Chr5:18960369`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765963.1

389 aa

194

389

WD40

PF00400 WD40 172-202 aa PF00400 WD40 207-242 aa PF00400 WD40 295-326 aa PF00400 WD40 335-377 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765963.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	172	202	2.4e-31	107.5	WD domain, G-beta repeat
`XP_057765963.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	207	242	2.4e-31	107.5	WD domain, G-beta repeat
`XP_057765963.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	295	326	2.4e-31	107.5	WD domain, G-beta repeat
`XP_057765963.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	335	377	2.4e-31	107.5	WD domain, G-beta repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909980.1
AAAACTAGGCATCTGAAATATTTCATTGAACTTATAGATTTTGTTACAAACATAGTTAGCACGCAAGAATTAGGTACCCCACTCCTTACACGTGTCCAAAAAATATTGCTTCATATATCCCTACAAATTCTGATCAATTCTCCCTCCACTCTTCCCAAACCCAGTCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCACACCCAGCTTTCTCTCAATTAGTTTGATTCTTTAAGATGAGTAATTTGTGGAAGTGAGATTTGAGATGATA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986540
ATGATACAAGAGCAAAGAAGGCAAACACTCTCATCAATGGACTCAAACATTAATCCAGCCAAGAAAAAGAAGAACAACATGGCTCACTCCGATTCCAACACGTCCTCATCCTCCAGCGCCGATAGCTCCCCACTGATGATGTCGCCATGGTCGCCCCTCCCCAAATTCCCATGCCCCACCGCCCTGGTGGGCTCAGAGGGCCACATATACTCCCTCGCCGTCAAGGACGGCCTCCTCTACACCGGCTCCGACAGCAACAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765963.1
MIQEQRRQTLSSMDSNINPAKKKKNNMAHSDSNTSSSSSADSSPLMMSPWSPLPKFPCPTALVGSEGHIYSLAVKDGLLYTGSDSNNIRAWRNMQEFDAFKSSSAFVKAIVISGDRIFTGHQDGRIRVWKMDSAGVHRQIGTLPTFFALLKASMRPHNYVQVKRHRRALWIKHADAVSCLSVSEEGGLLYSASWDTTFKVWDLHSSRCVQSVGAHDDAVNAVATGAGGLVYTGSADGTVKVWRRERDGKAVRHVLWRTLL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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