当前解析结果
SmilChr05G001884| 统一新 Gene ID | SmilChr05G001884 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G001884 |
| 描述 | probable hexosyltransferase MUCI70 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 19114101 - 19118149 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130986549 |
|---|---|
| GeneID | 130986549 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130986549 |
| 原始查询 | SmilChr05G001884 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | probable hexosyltransferase MUCI70 |
| 产物 | probable hexosyltransferase MUCI70 |
| Arabidopsis | AT5G42660 (AT5G42660)DNA-directed RNA polymerase subunit beta (DUF616) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834275] identity=65.5; qcov=0.998; evalue=0; confidence=high |
| Rice | Os01g0749100- identity=61.8; qcov=0.913; evalue=0; confidence=high |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF04765 (TOD1_MUCI70) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130986549 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Golgi apparatus | 高尔基体 | 1.00000 | XP_057765972.1 |
| 2 | Golgi stack | 高尔基堆 | 0.20000 | XP_057765972.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057765972.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057765972.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057765972.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:19114764 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B58,B77,D11 |
Chr5:19115393 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B112 |
Chr5:19116275 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B75,C20 |
Chr5:19116962 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B132 |
Chr5:19116970 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B105,B134,B37 |
Chr5:19117944 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A15,B22,B56,B96,D7 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057765972.1PF04765
TOD1_MUCI70 171-461 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057765972.1 |
Pfam | PF04765 |
TOD1_MUCI70 | Domain | 171 | 461 | 1.3e-120 | 403.1 | TOD1/MUCI70, glycosyltransferase-like domain |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。