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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001887`

染色体: Chr05 坐标: 19184342-19185230 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001887`
名称	SmilChr05G001887
描述	uncharacterized SmilChr05G001887
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	19184342 - 19185230 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025611`
GeneID	`131025611`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025611`
原始查询	`SmilChr05G001887`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0643433; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os03g0643433; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT4G20520` (AT4G20520) RNA binding / RNA-directed DNA polymerase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827800] identity=34.6; qcov=0.444; evalue=5.86e-07; confidence=low
Rice	`Os03g0643433` - identity=44.3; qcov=0.415; evalue=6.87e-16; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00078 (RVT_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025611

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057811393.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057811393.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057811393.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811393.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811393.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:19184385`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,B16,B64
`Chr5:19184395`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	69	A15,A22,A4,A7,B100,B102,B106,B107,B113,B117,B120,B122,B123,B125,B129,B137,B138,B139,B17,B19,B22,B31,B32,B40,B44,B46,B5,B54,B55,B56,B65,B67,B7,B75,B77,B83,B84,B85,B86,B88,B94,B96,C10,C11,C19,C23,C25,C28,C35,C38,C41,C42,C47,C5,C52,C55,C56,C59,C69,C73,C77,C81,C83,D11,D3,D4,D6,D7,D9
`Chr5:19184430`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B112,B76
`Chr5:19184437`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B117,B46
`Chr5:19184470`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B112
`Chr5:19184471`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C11,C45,C69
`Chr5:19184493`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	B38,B39,B57,C24,C32,C61,C68
`Chr5:19184502`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,B16,B64
`Chr5:19184531`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B130,B136,C33,D10
`Chr5:19184546`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B118,B3,C6,C79,C8
`Chr5:19184555`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B84
`Chr5:19184555`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B84

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811393.1

234 aa

117

234

RVT_1

PF00078 RVT_1 142-232 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811393.1`	Pfam	`PF00078`	RVT_1	Domain	142	232	6.6e-11	43.2	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955410.1
ATGGCTTCCGCTCGGCGCAAAAAGAACAATATTATTCATCTTCAGCGCGAGGATGGTAGCTGGACGGAGAATGATAATGAGATTAGAATTGTTGCTTGCGGGTACTTTGAAGGTATCTTTGATGAGTCTAATAGTGCTACTAACTATCTCCATGTGCTCGATAGGTTTAACCCTAACTTTGATAGTTCCATGAATGATGAACTTATCAAGCCATTTCTGGCAGAGGAGTTTAAAGTTGCCGTGTCCCAGATGCATCCGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025611
ATGGCTTCCGCTCGGCGCAAAAAGAACAATATTATTCATCTTCAGCGCGAGGATGGTAGCTGGACGGAGAATGATAATGAGATTAGAATTGTTGCTTGCGGGTACTTTGAAGGTATCTTTGATGAGTCTAATAGTGCTACTAACTATCTCCATGTGCTCGATAGGTTTAACCCTAACTTTGATAGTTCCATGAATGATGAACTTATCAAGCCATTTCTGGCAGAGGAGTTTAAAGTTGCCGTGTCCCAGATGCATCCGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811393.1
MASARRKKNNIIHLQREDGSWTENDNEIRIVACGYFEGIFDESNSATNYLHVLDRFNPNFDSSMNDELIKPFLAEEFKVAVSQMHPDKSPGSDEFNPKFFQNFWNMVGEDVYHSCCSWLDSMSFPPDLNHTLVTPHSKAIHFMKRKTRGKHGSLALKIDISKAYDRVDWGYLDAILQMMGFCDKWRAWMNLCVRTVSYEVLVNGEAIGPIIQGRGLRQGDPLSPYLIILCAEGL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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