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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001894`

染色体: Chr05 坐标: 19249832-19252081 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001894`
名称	SmilChr05G001894
描述	uncharacterized protein At3g06530-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	19249832 - 19252081 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986557`
GeneID	`130986557`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986557`
原始查询	`SmilChr05G001894`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ARM repeat superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819831]; symbol=AT3G06530; hit=AT3G06530; species=arabidopsis; confidence=high
产物	ARM repeat superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819831]; symbol=AT3G06530; hit=AT3G06530; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G06530` (AT3G06530) ARM repeat superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819831] identity=68.9; qcov=0.655; evalue=5.22e-65; confidence=high
Rice	`-` -
GO	GO:0000462 (maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)); GO:0030515 (snoRNA binding); GO:0030686 (90S preribosome); GO:0032040 (small-subunit processome); GO:0034455 (t-UTP complex); GO:0045943 (positive regulation of transcription by RNA polymerase I)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986557

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057765983.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057765983.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.60000	`XP_057765983.1`
4	Nuclear body	核内小体	0.20000	`XP_057765983.1`
5	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057765983.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:19250166`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	A16,B123
`Chr5:19250166`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,B123
`Chr5:19250182`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B94
`Chr5:19250182`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B94
`Chr5:19250206`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	A10,B72
`Chr5:19250206`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A10,B72
`Chr5:19250226`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	A16,B1,B4,B72,C30
`Chr5:19250226`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A16,B1,B4,B72,C30
`Chr5:19250264`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	49	A13,A2,A24,B1,B100,B113,B114,B118,B121,B123,B127,B135,B136,B138,B16,B23,B35,B41,B51,B53,B54,B55,B62,B66,B69,B7,B70,B73,B85,B88,B91,C11,C13,C27,C3,C37,C49,C52,C57,C58,C60,C69,C75,C77,C78,C79,D4,D7,D9
`Chr5:19250278`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A11,B13
`Chr5:19250330`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	A11,B13,B136
`Chr5:19250330`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	3	A11,B13,B136

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910000.1
TTAATACAAAATATCTGAACAAAAATAGAAACATCAGCCCTCTTGAATAGGAGAATTCCCAAATCCATTCAAAAAACAAAAGAAAAGGAGATAAATAATTGGAACTACTAATCTTTCATTTTTAAGAGAGCATGTATGTCTGTTTGACTGTTTCTCTTGTCCCATAGAGAGCTCCTCCCCTGGGCCTAATAAACACTTGGCCTAAACGATAATTTTCATCCCCTCTGGTCACCACATTAGAGGAAATTAAAAAGAATGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986557
ATGGAGGAGCGCTTTAGGAACTACAAGAATGATTTGTTCAGTTTCCAGAGCAAGGAGCTGGACAGGGAGTTGGTAGGCCAAGAAGAGAACAAGCGAATCAATGCATCACTTGGCTCGTATTTGAGATTGTTATCAGGATACCTCGAGTTGCATTCTGCATTGAAGACGCTGGAGTATTTGATTCGTAGATACAAGATTCATGTGTACAATGCAGAAGACCTGATTTTATGCGCATTGCCATATCACGACACACATGTATT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765983.1
MEERFRNYKNDLFSFQSKELDRELVGQEENKRINASLGSYLRLLSGYLELHSALKTLEYLIRRYKIHVYNAEDLILCALPYHDTHVFVQIIRLIDAGNSRWKFLDGVKESGARPPREVIVQHCVRDMGILETICNYVRLFWAYDFLISKLCSYHDYLKAYLIGDYFVPSACWVSSGRWVSSGAGTQRALASWISIPELSPKFFENQ

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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