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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001896`

染色体: Chr05 坐标: 19260704-19267673 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001896`
名称	SmilChr05G001896
描述	putative nitric oxide synthase
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	19260704 - 19267673 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986559`
GeneID	`130986559`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986559`
原始查询	`SmilChr05G001896`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative nitric oxide synthase
产物	putative nitric oxide synthase
Arabidopsis	`AT3G47450` (NOA1) P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823899] identity=63.9; qcov=0.998; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0104700` (NOA1) - identity=62.5; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003924 (GTPase activity); GO:0005525 (GTP binding)
KEGG	smil00220 (Arginine biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00330 (Arginine and proline metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04626 (Plant-pathogen interaction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01926 (MMR_HSR1); PF21516 (YqeH-like_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986559

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057765984.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.80000	`XP_057765984.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057765984.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765984.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765984.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:19260819`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A5,B50,B85,C37
`Chr5:19260925`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B137
`Chr5:19260925`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B137
`Chr5:19260952`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A13,B87,C30,C50
`Chr5:19261102`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B117
`Chr5:19261396`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B112
`Chr5:19261412`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C44
`Chr5:19263113`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C9
`Chr5:19263136`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr5:19263756`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C24
`Chr5:19266386`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B128
`Chr5:19266453`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B1,B16,B68,C14

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765984.1

566 aa

283

566

MMR_HSR1

YqeH-like_C

PF01926 MMR_HSR1 291-358 aa PF21516 YqeH-like_C 429-536 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765984.1`	Pfam	`PF01926`	MMR_HSR1	Family	291	358	1.6e-08	35.3	50S ribosome-binding GTPase
`XP_057765984.1`	Pfam	`PF21516`	YqeH-like_C	Domain	429	536	2.4e-14	54.3	YqeH-like, C-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910001.1
ACGTTTCAGCGACTCTCAAAATATCGACGCCTATCGTCTTCAACGCATTCCGTTACACTCTTATCACAGCAGACATCAATGGCGTTAGCCACCAAACCCCTCTCCTCTCTCTCTTCCCTCTCCTCATTCTCCACCCCTCACCCCTTCCACAAACACAACTCATACCTCGTTCTCCCCAAATATCACTCCCGCGCACTATCCCCTTCCGTCACTTGCAAATCCACCCCAACCGACGCCGCCGACTACCCGCTGTCAGAACT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986559
ATGGCGTTAGCCACCAAACCCCTCTCCTCTCTCTCTTCCCTCTCCTCATTCTCCACCCCTCACCCCTTCCACAAACACAACTCATACCTCGTTCTCCCCAAATATCACTCCCGCGCACTATCCCCTTCCGTCACTTGCAAATCCACCCCAACCGACGCCGCCGACTACCCGCTGTCAGAACTCGACGGCGCCGGAGCCGCCGCCCCAACCAGAGGCGACGTCTTCCTCCAAACCCATCACTCCTCAGCCGCTTCCTCCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765984.1
MALATKPLSSLSSLSSFSTPHPFHKHNSYLVLPKYHSRALSPSVTCKSTPTDAADYPLSELDGAGAAAPTRGDVFLQTHHSSAASSAVLAEIKKKKKKKEKNLEKAAKSSSLNSPSCYGCGAPLQKSEPDAPGYVEPDTYSLKKKHRQLQTVICGRCRLLSHGHMITAVGGNGGYSGGKQFVTAEELREKLSHLRHEKTLVVKLVDIVDFNGSFLARVRDHVGANPIILVVTKVDLLPKGTDFNCVGDWVVEATMKKKLN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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