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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001897`

染色体: Chr05 坐标: 19269798-19271538 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001897`
名称	SmilChr05G001897
描述	cytochrome P450 78A7-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	19269798 - 19271538 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986561`
GeneID	`130986561`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986561`
原始查询	`SmilChr05G001897`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cytochrome P450 78A7-like
产物	cytochrome P450 78A7-like
Arabidopsis	`AT5G09970` (CYP78A7) cytochrome P450, family 78, subfamily A, polypeptide 7 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830858] identity=66.6; qcov=0.993; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os10g0403000` (PLA1) - identity=63.1; qcov=0.989; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004497 (monooxygenase activity); GO:0005506 (iron ion binding); GO:0016705 (oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen); GO:0020037 (heme binding)
KEGG	-
Pfam	PF00067 (p450)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986561

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057765985.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057765985.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057765985.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765985.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765985.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:19269873`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B42,B43
`Chr5:19269894`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B130,B136,C33,D10
`Chr5:19269914`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr5:19269986`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B101,C9
`Chr5:19270160`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr5:19270174`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C24
`Chr5:19270174`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C24
`Chr5:19270196`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A8,B30,B35,C36
`Chr5:19270278`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B136,B49,B50,B84,C36
`Chr5:19270292`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C9
`Chr5:19270349`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B128
`Chr5:19270371`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B128

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765985.1

537 aa

268

537

p450

PF00067 p450 69-517 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765985.1`	Pfam	`PF00067`	p450	Domain	69	517	7e-89	299.4	Cytochrome P450

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910002.1
ATGGATATGAGCATAGCTAGTAAGGATTCTAGTTGGTGGATTTTCACTCTTCCAGCTTTTCTTGGGGCTAAGACCCTCCTCGATGAATATGTAATTGTTGCAATTCTCTTATCTTTCATCTCTATTGCTCTTCTCACGTGGTTTTCCTCCCATGGTGGAATGGCATGGAAGAATGGTCGGAATAGTAACGGCAGCGTCACCATCCGTGGCCCACGGGGGCTTCCCATTTTTGGGAGCCTCTTCACTCTTAGTCGTGGCTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986561
ATGGATATGAGCATAGCTAGTAAGGATTCTAGTTGGTGGATTTTCACTCTTCCAGCTTTTCTTGGGGCTAAGACCCTCCTCGATGAATATGTAATTGTTGCAATTCTCTTATCTTTCATCTCTATTGCTCTTCTCACGTGGTTTTCCTCCCATGGTGGAATGGCATGGAAGAATGGTCGGAATAGTAACGGCAGCGTCACCATCCGTGGCCCACGGGGGCTTCCCATTTTTGGGAGCCTCTTCACTCTTAGTCGTGGCTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765985.1
MDMSIASKDSSWWIFTLPAFLGAKTLLDEYVIVAILLSFISIALLTWFSSHGGMAWKNGRNSNGSVTIRGPRGLPIFGSLFTLSRGLAHRSLAAMAKVHNAKQLMAFSLGSTPIVVASDPQVAKEILTSPDFADRPIKQSARSLMFSRAIGFAPNGTYWRLLRRIAASHLFAPRRVTAHEHGRQQDCDAMLHNIEMEQKLKGSVSLRKHLQAAALNNIMGSVFGKRYDPTEDSEELRELKQMVEEGFHLLGAFNWSDYLP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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