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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001909`

染色体: Chr05 坐标: 19365804-19368519 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001909`
名称	SmilChr05G001909
描述	uncharacterized SmilChr05G001909
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	19365804 - 19368519 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986567`
GeneID	`130986567`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986567`
原始查询	`SmilChr05G001909`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	histone deacetylase complex subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843844]; symbol=AT1G75060; hit=AT1G75060; species=arabidopsis; confidence=high
产物	histone deacetylase complex subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843844]; symbol=AT1G75060; hit=AT1G75060; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G75060` (AT1G75060) histone deacetylase complex subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843844] identity=65.8; qcov=1.05; evalue=1.02e-95; confidence=high
Rice	`Os10g0358600` - identity=71.1; qcov=0.901; evalue=5.2e-91; confidence=high
GO	GO:0000118 (histone deacetylase complex); GO:0003712 (transcription coregulator activity); GO:0005515 (protein binding); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF13867 (SAP30_Sin3_bdg)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986567

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057765993.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057765993.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057765993.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765993.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765993.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:19366549`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B32,B9
`Chr5:19368178`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,C56

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765993.1

223 aa

112

223

SAP30_Sin3_bdg

PF13867 SAP30_Sin3_bdg 163-216 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765993.1`	Pfam	`PF13867`	SAP30_Sin3_bdg	Family	163	216	2.3e-20	73.4	Sin3 binding region of histone deacetylase complex subunit SAP30

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910010.1
AATAATTAAAGTTAAACAAAAGAGCAGCAAGAAAACACAAACGTACTCTCTCTCTCTCATCTTCTTACCTGTTCCTCCCATCTCCAGTCACACTGTGTTTTCTCTCTCCAAAAAAAGACCCAAATTCTTCCTGAATTGGCAGCACTCTTCATCCAGAGACGCCGAGAAGCTGCACCAACCAATGAATTGTCTTCCCATCGGGCCTCATTTGAATATCGGGAATTGAGTTCATTAATTTTTCTATAATATTTGCAAGACAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986567
ATGCTGGAAGCTGCAGCAGTGGTGAGCAATGGCGGATTCTCTTCTCACTCATCGCATCTGCACAGCTGCGGCGACAGCTCCGAGGAGGAGCTATCGGTTTTACCTCGCCACACCAAGGTGGTGGTCACCGGAAACAATCGCACTAAGTCGGTGCTGGTGGGGCTTCAGGGCGTCGTCAAGAAAGCTGTTGGCCTCGGTGGATGGCATTGGCTGGTTCTCACTAATGGTATTGAGGTGAAGTTGCAAAGGAATGCTCTAAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765993.1
MLEAAAVVSNGGFSSHSSHLHSCGDSSEEELSVLPRHTKVVVTGNNRTKSVLVGLQGVVKKAVGLGGWHWLVLTNGIEVKLQRNALSVLEAPTGNEEDDYLEIEHEQWNSSDIAFDDGHKSHRSRHRMHRSSNKTLRGPLSSDSQLKGSVSTAKGSSVDLSKLEMAALWRYALHFNLVDTNPNPSKEQLINVVQRHFVSQQLDELQVIAGFVQAAKRLKTVCK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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