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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001916`

染色体: Chr05 坐标: 19424002-19427947 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001916`
名称	SmilChr05G001916
描述	methyltransferase-like protein 2
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	19424002 - 19427947 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986578`
GeneID	`130986578`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986578`
原始查询	`SmilChr05G001916`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	methyltransferase-like protein 2
产物	methyltransferase-like protein 2
Arabidopsis	`AT1G19340` (AT1G19340) Methyltransferase MT-A70 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838516] identity=53.9; qcov=0.923; evalue=3.66e-130; confidence=high
Rice	`Os03g0198900` (TagI) - identity=48.8; qcov=0.889; evalue=5.95e-108; confidence=high
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0008168 (methyltransferase activity); GO:0036396 (RNA N6-methyladenosine methyltransferase complex); GO:0080009 (GO:0080009)
KEGG	-
Pfam	PF05063 (MT-A70)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986578

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057766004.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057766008.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057766008.1`
4	Nuclear body	核内小体	0.20000	`XP_057766008.1`
5	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057766008.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:19424319`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B38,B39
`Chr5:19424350`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B39
`Chr5:19426508`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A15
`Chr5:19426508`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A15
`Chr5:19426598`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A4,A8,C19,C48,C69
`Chr5:19426601`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr5:19427011`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B104
`Chr5:19427011`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:19427746`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B13,C34,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766004.1

430 aa

215

430

MT-A70

PF05063 MT-A70 235-408 aa

XP_057766005.1

428 aa

214

428

MT-A70

PF05063 MT-A70 235-406 aa

XP_057766006.1

425 aa

212

425

MT-A70

PF05063 MT-A70 235-408 aa

XP_057766007.1

423 aa

212

423

MT-A70

PF05063 MT-A70 235-408 aa

XP_057766008.1

378 aa

189

378

MT-A70

PF05063 MT-A70 183-356 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766004.1`	Pfam	`PF05063`	MT-A70	Family	235	408	1.4e-30	107.2	MT-A70
`XP_057766005.1`	Pfam	`PF05063`	MT-A70	Family	235	406	3.7e-29	102.6	MT-A70
`XP_057766006.1`	Pfam	`PF05063`	MT-A70	Family	235	408	1.4e-30	107.2	MT-A70
`XP_057766007.1`	Pfam	`PF05063`	MT-A70	Family	235	408	1.4e-30	107.2	MT-A70
`XP_057766008.1`	Pfam	`PF05063`	MT-A70	Family	183	356	1.1e-30	107.6	MT-A70

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

6 records

下载 cDNA FASTA

XR_009089308.1
AGCAAATGGGCCTTGTATTTGCAGTTGTGGAGCAGAAAACAAGTAACGATTTTGGGCCGGATTCACCTATCCAAATACCCCTCATTGCAACTCGTCGTCGCCGGTAATGGCTGCCTCCGAGCCGGACGGACGGTTAGCTGCCTTCCTAAAATCGGGCACCTACAGGTTTGATGAGTCCACCATATACTTCATCGATCCGGTTCGGGTCCTGAACCGGTCCTACACCCGGATTAGGGTTTCTCCGTCGGCTTACTACTCCC...

XM_057910021.1
AGCAAATGGGCCTTGTATTTGCAGTTGTGGAGCAGAAAACAAGTAACGATTTTGGGCCGGATTCACCTATCCAAATACCCCTCATTGCAACTCGTCGTCGCCGGTAATGGCTGCCTCCGAGCCGGACGGACGGTTAGCTGCCTTCCTAAAATCGGGCACCTACAGGTTTGATGAGTCCACCATATACTTCATCGATCCGGTTCGGGTCCTGAACCGGTCCTACACCCGGATTAGGGTTTCTCCGTCGGCTTACTACTCCC...

CDS

5 records

下载 CDS FASTA

LOC130986578
ATGGCTGCCTCCGAGCCGGACGGACGGTTAGCTGCCTTCCTAAAATCGGGCACCTACAGGTTTGATGAGTCCACCATATACTTCATCGATCCGGTTCGGGTCCTGAACCGGTCCTACACCCGGATTAGGGTTTCTCCGTCGGCTTACTACTCCCGCTTCTTCGCCTCTTCTAATTCTTCAATCGATAATCCCGATGCTTCGCCCAATAATCCCAGGAAGCGCAAATGCCGCGGAAAGGAGAAGAAGAAATATCGGGCGCT...

Protein

5 records

下载 Protein FASTA

XP_057766004.1
MAASEPDGRLAAFLKSGTYRFDESTIYFIDPVRVLNRSYTRIRVSPSAYYSRFFASSNSSIDNPDASPNNPRKRKCRGKEKKKYRALNSREQLADRRHQEVRAGLLKAHEALLGASELLGVLRNLRSDGQGNCGELTFAERELDFVELGSVWQAPFYEIVLKIGDDGSAVENAGFGSSNQIEVPVFDNLIANEWSTDIEAELLEHKYILPKKSCVYMSDLRQIHKLIPAESDRGFNLIVIDPPWENSSAHQKQKYRTLPN...

XP_057766005.1
MAASEPDGRLAAFLKSGTYRFDESTIYFIDPVRVLNRSYTRIRVSPSAYYSRFFASSNSSIDNPDASPNNPRKRKCRGKEKKKYRALNSREQLADRRHQEVRAGLLKAHEALLGASELLGVLRNLRSDGQGNCGELTFAERELDFVELGSVWQAPFYEIVLKIGDDGSAVENAGFGSSNQIEVPVFDNLIANEWSTDIEAELLEHKYILPKKSCVYMSDLRQIHKLIPAESDRGFNLIVIDPPWENSSAHQKQKYRTLPN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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