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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001921`

染色体: Chr05 坐标: 19476355-19479194 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001921`
名称	SmilChr05G001921
描述	uncharacterized SmilChr05G001921
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	19476355 - 19479194 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025617`
GeneID	`131025617`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025617`
原始查询	`SmilChr05G001921`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0683500; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0683500; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G25270` (AT3G25270) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822121] identity=24.6; qcov=0.65; evalue=2.44e-10; confidence=weak
Rice	`Os06g0683500` - identity=34.6; qcov=0.364; evalue=7.57e-13; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004523 (RNA-DNA hybrid ribonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF13456 (RVT_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025617

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057811398.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057811398.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057811398.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057811398.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811398.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:19476393`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,A23,B79,C56,C59
`Chr5:19476415`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A5
`Chr5:19476429`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A5,A8,C59,C7
`Chr5:19476438`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	D11
`Chr5:19476438`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:19476487`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B82
`Chr5:19476487`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr5:19476542`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr5:19476606`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B137,C53,C8
`Chr5:19476606`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B137,C53,C8
`Chr5:19476616`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B137,B77,C53,C8
`Chr5:19476624`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811398.1

357 aa

178

357

RVT_3

PF13456 RVT_3 231-351 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811398.1`	Pfam	`PF13456`	RVT_3	Domain	231	351	1.6e-19	70.8	Reverse transcriptase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955415.1
ATGGCTTCGCCGCCGTTGAGCAAGGGGACGGCGCCGCGTGGCTCGGCTGCAGAACCTAGAGCAGAGGAGGCGATTTGGGGGGTGTGGTTTTGCAGAGGGCGCCGCCGCCGTTTGAGAAATGGTCGGCAGCTCTGTTGGTGGAGGAGGGCGGCGGAGGGGGGCCTCTGCTGGTGGGAGAAGGCGGCGACTCTGTTGGTGGAGGAGGGTGGCGAAGGGGGGAGGGACAGCTCTGCTGGTGGGAGGCAGGATGCTGAATCGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025617
ATGGCTTCGCCGCCGTTGAGCAAGGGGACGGCGCCGCGTGGCTCGGCTGCAGAACCTAGAGCAGAGGAGGCGATTTGGGGGGTGTGGTTTTGCAGAGGGCGCCGCCGCCGTTTGAGAAATGGTCGGCAGCTCTGTTGGTGGAGGAGGGCGGCGGAGGGGGGCCTCTGCTGGTGGGAGAAGGCGGCGACTCTGTTGGTGGAGGAGGGTGGCGAAGGGGGGAGGGACAGCTCTGCTGGTGGGAGGCAGGATGCTGAATCGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811398.1
MASPPLSKGTAPRGSAAEPRAEEAIWGVWFCRGRRRRLRNGRQLCWWRRAAEGGLCWWEKAATLLVEEGGEGGRDSSAGGRQDAESIDHIFWACGQVKEVWSSFLAWFGVEYLSECVDLHSFLVEAWNLNFSPQITSFWKAGIVTLVWKIWHDRNKIVFDNAGFHGPGVLNFIKVYFKEMEANFTRLGHVSSAWQDYVITRAIGVQSRIAPPPEMVNVYWWPPFGDWMKVNTDGSALGAPGLISAGGVFRDSWGQIRGCF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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