当前解析结果
SmilChr05G001925| 统一新 Gene ID | SmilChr05G001925 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G001925 |
| 描述 | NAD(H) kinase 1-like |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 19521808 - 19524977 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130986585 |
|---|---|
| GeneID | 130986585 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130986585 |
| 原始查询 | SmilChr05G001925 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | NAD(H) kinase 1-like |
| 产物 | NAD(H) kinase 1-like |
| Arabidopsis | AT3G21070 (NADK1)NAD kinase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821659] identity=48.9; qcov=0.516; evalue=5.78e-07; confidence=low |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130986585 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057766016.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057766016.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057766016.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057766016.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057766016.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:19522125 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | B96 |
Chr5:19522125 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B96 |
Chr5:19522127 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B3,B36,B38,B92,D10 |
Chr5:19522129 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B135,B15,B42,B91 |
Chr5:19522149 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 2 | A14,B20 |
Chr5:19522149 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A14,B20 |
Chr5:19522158 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | B15 |
Chr5:19522158 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B15 |
Chr5:19522685 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B140,C47 |
Chr5:19523529 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B28 |
Chr5:19523550 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B48,C12 |
Chr5:19523569 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 7 | A9,B117,B32,B82,B98,C31,C67 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。