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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001928`

染色体: Chr05 坐标: 19589969-19590709 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001928`
名称	SmilChr05G001928
描述	uncharacterized SmilChr05G001928
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	19589969 - 19590709 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025620`
GeneID	`131025620`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025620`
原始查询	`SmilChr05G001928`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	tRNA-methyltransferase non-catalytic subunit trm6MTase subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836776]; symbol=AT5G66440; hit=AT5G66440; species=arabidopsis; confidence=low
产物	tRNA-methyltransferase non-catalytic subunit trm6MTase subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836776]; symbol=AT5G66440; hit=AT5G66440; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G66440` (AT5G66440) tRNA-methyltransferase non-catalytic subunit trm6MTase subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836776] identity=27.9; qcov=0.992; evalue=2.09e-15; confidence=low
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025620

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057811400.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.60000	`XP_057811400.1`
3	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057811400.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057811400.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811400.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:19589992`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66
`Chr5:19590094`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B121,B60,C16,C33,C86
`Chr5:19590141`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B65,B67,C19
`Chr5:19590271`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B8
`Chr5:19590272`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B8
`Chr5:19590277`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A22
`Chr5:19590445`	`GGC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	84	A1,A3,A5,B1,B100,B101,B111,B114,B119,B120,B121,B127,B129,B13,B130,B131,B139,B14,B17,B18,B20,B23,B25,B27,B28,B3,B32,B4,B40,B42,B43,B45,B49,B50,B53,B54,B55,B58,B59,B60,B64,B65,B66,B67,B70,B73,B75,B76,B82,B83,B84,B85,B86,B89,B90,B92,B95,B96,B97,B99,C1,C11,C14,C15,C19,C22,C23,C24,C27,C29,C31,C42,C44,C47,C51,C52,C57,C61,C62,C7,C82,C83,D3,D7
`Chr5:19590480`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	87	A1,A11,A3,A5,B1,B100,B101,B111,B114,B119,B120,B121,B127,B129,B13,B130,B131,B132,B134,B139,B14,B17,B18,B20,B23,B25,B27,B28,B3,B32,B4,B40,B42,B43,B45,B49,B50,B53,B54,B55,B58,B59,B60,B64,B65,B66,B67,B70,B73,B75,B76,B82,B83,B84,B85,B86,B89,B90,B92,B95,B96,B97,B99,C1,C11,C14,C15,C19,C21,C22,C24,C29,C31,C42,C44,C47,C51,C52,C57,C61,C62,C7,C82,C83,D11,D3,D7
`Chr5:19590610`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B120,B39,C72,C81

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955417.1
ATGGAATCCCCCTCCAAAATGTTCGATAACGTCAAGTTCGAGAAGGAGAAGGCCATTGCGCGCTTCAATCGCGTGCGCAGAGTCATGAGGCTGTTGCAGATTATTCAAGTCGCCGGCGTCTTCGCCGCCGTCTCGTGGTGCTCGGTGCGCGCGCCGGCGGTTGCTATGTCTGCCGGCGCGTCTTTGCTCGAGTTCTCCACGTACCTCTTCAACCACCACGTCGCGTTCCTAATCGGAAATGCGATCATCGTGTTGCTGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025620
ATGGAATCCCCCTCCAAAATGTTCGATAACGTCAAGTTCGAGAAGGAGAAGGCCATTGCGCGCTTCAATCGCGTGCGCAGAGTCATGAGGCTGTTGCAGATTATTCAAGTCGCCGGCGTCTTCGCCGCCGTCTCGTGGTGCTCGGTGCGCGCGCCGGCGGTTGCTATGTCTGCCGGCGCGTCTTTGCTCGAGTTCTCCACGTACCTCTTCAACCACCACGTCGCGTTCCTAATCGGAAATGCGATCATCGTGTTGCTGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811400.1
MESPSKMFDNVKFEKEKAIARFNRVRRVMRLLQIIQVAGVFAAVSWCSVRAPAVAMSAGASLLEFSTYLFNHHVAFLIGNAIIVLLFMLCRQSDGGASASSRRDLYDDYAKYSDAARSLPQPEQREEVAAPPAEFGGGNQQIVAVIADEASASSQCDDVAAAIEKAARQIKKFQRNRSEMMLRREIAVRPELRRSETEKHRKLVSSGSAEIENLSNEEFRRRVDAFIDKHWIKTTAKLEGHQNHGW

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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