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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001936`

染色体: Chr05 坐标: 19705725-19708507 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001936`
名称	SmilChr05G001936
描述	uncharacterized SmilChr05G001936
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	19705725 - 19708507 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025624`
GeneID	`131025624`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025624`
原始查询	`SmilChr05G001936`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0643433; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os03g0643433; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G24255` (AT3G24255) RNA-directed DNA polymerase (reverse transcriptase)-related family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822013] identity=31.6; qcov=0.367; evalue=6.44e-33; confidence=low
Rice	`Os03g0643433` - identity=28.5; qcov=0.607; evalue=5.54e-54; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding)
KEGG	-
Pfam	PF00078 (RVT_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025624

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057811404.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057811404.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057811404.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811404.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811404.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:19705758`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	21	A24,B100,B118,B125,B138,B17,B20,B48,B55,B67,B7,B71,B77,B98,C11,C19,C23,C42,C61,C8,D3
`Chr5:19705780`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B124,B132,B66
`Chr5:19705782`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C54
`Chr5:19705782`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C54
`Chr5:19705877`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:19705892`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr5:19705916`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B57,C24,C32,C68
`Chr5:19706020`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B124,B132,B66
`Chr5:19706022`	`G`	`GCC`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	B137,C6,C79
`Chr5:19706022`	`G`	`GCC`	2bp_insertion	CDS_variant	3	B137,C6,C79
`Chr5:19706032`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C45,C61,C85
`Chr5:19706067`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811404.1

733 aa

366

733

RVT_1

PF00078 RVT_1 133-389 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811404.1`	Pfam	`PF00078`	RVT_1	Domain	133	389	2.8e-26	93.4	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955421.1
ATGACTACCTCAAAAGTTGCATTCTTCCATAGTCGACTTCGGGTAAAGAAGAATGGCATTTTTATTGGGCATCTTAATATTGGAGGCTCCACTGTTTATGATCAGTATGTGATTGAGCAACATATTGAGGAGCATTTCTCGAGGCTGTTCTCGCATGAAGAGGCCGAGAATATTGATATAACCATGATTGAGGCGAATGTTCATTCCATTATTACTACGATGCAGAATGCTAAGTTGATTGATATTCGTTCTGATGTTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025624
ATGACTACCTCAAAAGTTGCATTCTTCCATAGTCGACTTCGGGTAAAGAAGAATGGCATTTTTATTGGGCATCTTAATATTGGAGGCTCCACTGTTTATGATCAGTATGTGATTGAGCAACATATTGAGGAGCATTTCTCGAGGCTGTTCTCGCATGAAGAGGCCGAGAATATTGATATAACCATGATTGAGGCGAATGTTCATTCCATTATTACTACGATGCAGAATGCTAAGTTGATTGATATTCGTTCTGATGTTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811404.1
MTTSKVAFFHSRLRVKKNGIFIGHLNIGGSTVYDQYVIEQHIEEHFSRLFSHEEAENIDITMIEANVHSIITTMQNAKLIDIRSDVEIEAAIFSMDIHRALGPDGFSGITSAGKSFVRMCLGLLAVGQCEYSGGLRPIILSNFLFKIISKIMALRLNEVVASTVSQNQFDFISGHTIHDCIMLGSEGFNCMAGTSRGSNIACKIDIRKAFDTIRWDFIFMVMRVLGYHERFIHWISIIFSSARISILYNGRLSGYFPCSR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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