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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001943`

染色体: Chr05 坐标: 19789373-19793769 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001943`
名称	SmilChr05G001943
描述	probable ubiquitin-conjugating enzyme E2 18
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	19789373 - 19793769 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986600`
GeneID	`130986600`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986600`
原始查询	`SmilChr05G001943`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable ubiquitin-conjugating enzyme E2 18
产物	probable ubiquitin-conjugating enzyme E2 18
Arabidopsis	`AT5G42990` (UBC18) ubiquitin-conjugating enzyme 18 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834314] identity=88.2; qcov=0.77; evalue=6.27e-100; confidence=high
Rice	`Os03g0681400` (OsUBC25) - identity=88.8; qcov=0.77; evalue=4.98e-101; confidence=high
GO	-
KEGG	smil04120 (Ubiquitin mediated proteolysis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00179 (UQ_con)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986600

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057766035.1`
2	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057766036.1`
3	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057766035.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057766035.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766035.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:19789751`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C68,D11
`Chr5:19789775`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B50,B84
`Chr5:19789792`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr5:19789862`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C64,C66
`Chr5:19792875`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766035.1

238 aa

119

238

UQ_con

PF00179 UQ_con 67-176 aa

XP_057766036.1

209 aa

104

209

UQ_con

PF00179 UQ_con 67-202 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766035.1`	Pfam	`PF00179`	UQ_con	Domain	67	176	7.4e-36	123.5	Ubiquitin-conjugating enzyme
`XP_057766036.1`	Pfam	`PF00179`	UQ_con	Domain	67	202	3.3e-39	134.4	Ubiquitin-conjugating enzyme

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910053.1
AGAACCGAAAAGTAAAAGAAAAAGATACTGTATGAAATGAAATTAAAGAAAGATGAAAGAAGTGTATGAAACGGCGGCGTTTAAAAAAGCAGCACCGCTAGACCTACTCTGCCCCCTTAAGAGCAAGCAGCATGAATTCCTTCTCCAACGTTTAACTCTTCCTCGCAATAATTCCTCTATCAATTTTTCGTGCACGATGACCTCAGACTCCGGTTCCTCACGCAAGGCATTGAGCAAGATCGCGTGCAATCGGCTGCAGA...

XM_057910052.1
ATGAAATGAAATTAAAGAAAGATGAAAGAAGTGTATGAAACGGCGGCGTTTAAAAAAGCAGCACCGCTAGACCTACTCTGCCCCCTTAAGAGCAAGCAGCATGAATTCCTTCTCCAACGTTTAACTCTTCCTCGCAATAATTCCTCTATCAATTTTTCGTGCACGATGACCTCAGACTCCGGTTCCTCACGCAAGGCATTGAGCAAGATCGCGTGCAATCGGCTGCAGAAAGAGCTGGTGGAGTGGCAGGTGAATCCGCC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130986600
ATGAAAGAAGTGTATGAAACGGCGGCGTTTAAAAAAGCAGCACCGCTAGACCTACTCTGCCCCCTTAAGAGCAAGCAGCATGAATTCCTTCTCCAACGTTTAACTCTTCCTCGCAATAATTCCTCTATCAATTTTTCGTGCACGATGACCTCAGACTCCGGTTCCTCACGCAAGGCATTGAGCAAGATCGCGTGCAATCGGCTGCAGAAAGAGCTGGTGGAGTGGCAGGTGAATCCGCCTGCCGGTTTTAAGCATAAGCC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057766035.1
MKEVYETAAFKKAAPLDLLCPLKSKQHEFLLQRLTLPRNNSSINFSCTMTSDSGSSRKALSKIACNRLQKELVEWQVNPPAGFKHKPTDNLKRWVIEVNGAPGTLYSGETYQLQVDFPEHYPMEAPQVIFVPPAPLHPHIYSNGHICLDILYDSWSPAMTVSSICISILSMLSSSTAKVCPIFNCRFFISESKLLLDIDPFELCCAQQRPADNDRYVKNCKNGRSPKETRWWFHDDKV

XP_057766036.1
MKEVYETAAFKKAAPLDLLCPLKSKQHEFLLQRLTLPRNNSSINFSCTMTSDSGSSRKALSKIACNRLQKELVEWQVNPPAGFKHKPTDNLKRWVIEVNGAPGTLYSGETYQLQVDFPEHYPMEAPQVIFVPPAPLHPHIYSNGHICLDILYDSWSPAMTVSSICISILSMLSSSTAKQRPADNDRYVKNCKNGRSPKETRWWFHDDKV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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