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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001947`

染色体: Chr05 坐标: 19828639-19831928 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001947`
名称	SmilChr05G001947
描述	jacalin-related lectin 3
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	19828639 - 19831928 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986602`
GeneID	`130986602`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986602`
原始查询	`SmilChr05G001947`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	jacalin-related lectin 3
产物	jacalin-related lectin 3
Arabidopsis	`AT1G19715` (AT1G19715) Mannose-binding lectin superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838560] identity=51.9; qcov=0.98; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0508400` - identity=48.1; qcov=1.03; evalue=5.78e-173; confidence=high
GO	GO:0030246 (carbohydrate binding)
KEGG	-
Pfam	PF01419 (Jacalin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986602

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057766040.1`
2	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057766040.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057766040.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766040.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766040.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:19828899`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr5:19829004`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B3,C6,C79
`Chr5:19829913`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D6
`Chr5:19829913`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D6
`Chr5:19830071`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr5:19830582`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B42,B43,D10
`Chr5:19830610`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr5:19830636`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr5:19830701`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B44,B45,B72,C83,C84
`Chr5:19830748`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B136,B37,C33,D7
`Chr5:19830783`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr5:19830817`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B20,B49,C58

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766040.1

604 aa

302

604

Jacalin

PF01419 Jacalin 13-149 aa PF01419 Jacalin 243-380 aa PF01419 Jacalin 444-583 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766040.1`	Pfam	`PF01419`	Jacalin	Repeat	13	149	5e-126	416.2	Jacalin-like lectin domain
`XP_057766040.1`	Pfam	`PF01419`	Jacalin	Repeat	243	380	5e-126	416.2	Jacalin-like lectin domain
`XP_057766040.1`	Pfam	`PF01419`	Jacalin	Repeat	444	583	5e-126	416.2	Jacalin-like lectin domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910057.1
CTGTTGTGTTCCATGTATATTAATTGTAATCTCTCATAAATATAACATTGTTCTCAATAGCTCTCTCTGTGATCAGCGATAGTAAAATGAATTTGGAGAGGTATGGAAAGCAGACGGTGTTGGTGGGGCCGTGGGGCGGGCAAGAGGGGCAATATTGGGACGACGGCGTGTACTCGAGGGTGAGGCAAGTGGAGGTGAGCCATGGAGATGTAATAGATTCTATCAGAATCGAATACGACATCAATGGAAGATCCATCTGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986602
ATGAATTTGGAGAGGTATGGAAAGCAGACGGTGTTGGTGGGGCCGTGGGGCGGGCAAGAGGGGCAATATTGGGACGACGGCGTGTACTCGAGGGTGAGGCAAGTGGAGGTGAGCCATGGAGATGTAATAGATTCTATCAGAATCGAATACGACATCAATGGAAGATCCATCTGGTCTGAAATTCATGGTGGCACTGGAGGCTCCAAGATAGATAAGATTAGGATGGAGTATCCAGACGAGTACCTAACGTGGGTGCACGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766040.1
MNLERYGKQTVLVGPWGGQEGQYWDDGVYSRVRQVEVSHGDVIDSIRIEYDINGRSIWSEIHGGTGGSKIDKIRMEYPDEYLTWVHGYFGHVYERGPVFVRALTLHSNMRSFGPFGVEQGTYFAFPQLQGRIVGFLGKSGWFLDAIGAYIEPLQNPHSIYYSTSQPTHTYEYSMIQGSLGTNYDLILALRQKENNRTTYNPTNLSPPNSQSSKIFTNQNGGGGTSEKIIERVASKNISGVVTSGPWGGSGGSAFDDGVYD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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