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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001954`

染色体: Chr05 坐标: 19980235-19982572 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001954`
名称	SmilChr05G001954
描述	protein ALP1-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	19980235 - 19982572 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025627`
GeneID	`131025627`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025627`
原始查询	`SmilChr05G001954`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein ALP1-like
产物	protein ALP1-like
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=38.4; qcov=0.688; evalue=5.51e-45; confidence=medium
Rice	`Os06g0597250` - identity=44.1; qcov=1; evalue=1.61e-107; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran); PF13359 (DDE_Tnp_4); PF28509 (DUF8418)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025627

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057811406.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057811406.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811406.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057811406.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057811406.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:19980299`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C21
`Chr5:19980307`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	88	A11,A14,A16,A21,A23,A3,A4,A6,A7,A8,B100,B103,B104,B106,B108,B109,B11,B111,B112,B113,B117,B118,B12,B120,B122,B125,B126,B127,B129,B131,B138,B17,B19,B2,B26,B33,B34,B35,B40,B42,B43,B48,B5,B55,B56,B58,B6,B60,B61,B64,B65,B67,B7,B71,B74,B75,B77,B78,B8,B80,B84,B96,B97,B98,C11,C12,C18,C19,C23,C28,C30,C35,C39,C41,C5,C59,C60,C67,C69,C72,C77,C81,C83,C85,D11,D4,D5,D9
`Chr5:19981303`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B58
`Chr5:19981310`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B48
`Chr5:19981327`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A22,B7,C79
`Chr5:19981333`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B42,B43
`Chr5:19981370`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	12	A10,A23,B136,B137,B29,B63,B67,B85,B86,C20,C51,C76
`Chr5:19981384`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B32,B65
`Chr5:19981391`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B137,C40
`Chr5:19981403`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B69
`Chr5:19981403`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B69
`Chr5:19981473`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B9,C84

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811406.1

420 aa

210

420

DUF8418

Plant_tran

DDE_Tnp_4

PF28509 DUF8418 61-96 aa PF04827 Plant_tran 136-339 aa PF13359 DDE_Tnp_4 189-330 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811406.1`	Pfam	`PF28509`	DUF8418	Domain	61	96	4.1e-19	68.8	Domain of unknown function (DUF8418)
`XP_057811406.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	136	339	2.4e-90	302.4	Plant transposon protein
`XP_057811406.1`	Pfam	`PF13359`	DDE_Tnp_4	Domain	189	330	1.1e-09	38.9	DDE superfamily endonuclease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955423.1
ATGTCTTCCTCCTCATCAAGCTACGAGGACGAGCGACGTGCTGAAGAATTTTCCAATCTTGTACAACAATTTAACCAAATTGTTCAAGATATTGGTGATCCAGAAGAGCAACCTCGTCGTCGCCGACGAGGTGCGCGGAAGAAGGCTTTCATTCGTCAGGACCGTGAAGCCAGCGCTGTACGTTTGCACGCGGATTACTTTGATGAAAATCCGGTCTACCCCGACACCATCTTCCGCTGCCGTTTTCGAATGCGTCGTGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025627
ATGTCTTCCTCCTCATCAAGCTACGAGGACGAGCGACGTGCTGAAGAATTTTCCAATCTTGTACAACAATTTAACCAAATTGTTCAAGATATTGGTGATCCAGAAGAGCAACCTCGTCGTCGCCGACGAGGTGCGCGGAAGAAGGCTTTCATTCGTCAGGACCGTGAAGCCAGCGCTGTACGTTTGCACGCGGATTACTTTGATGAAAATCCGGTCTACCCCGACACCATCTTCCGCTGCCGTTTTCGAATGCGTCGTGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811406.1
MSSSSSSYEDERRAEEFSNLVQQFNQIVQDIGDPEEQPRRRRRGARKKAFIRQDREASAVRLHADYFDENPVYPDTIFRCRFRMRRALFLRIVNAVAADPYFQQRTDALGRPGFHAIAKMHCRYSVEPLFNSSAQEYLRRPTSADCQQLLAMHETKHGFPGMLGCLDCMHWAWKNYPTAWQGAYTRGDQGELTIILEAVASQDLWIWHAFLGTPGSNNDINVLNNSTLFNDRLQGMGVPVTYQVNNAYYTSEYYLTDGIY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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