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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001962`

染色体: Chr05 坐标: 20176915-20178102 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001962`
名称	SmilChr05G001962
描述	uncharacterized SmilChr05G001962
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	20176915 - 20178102 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025629`
GeneID	`131025629`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025629`
原始查询	`SmilChr05G001962`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DNAse I-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840968]; symbol=AT1G43760; hit=AT1G43760; species=arabidopsis; confidence=weak
产物	DNAse I-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840968]; symbol=AT1G43760; hit=AT1G43760; species=arabidopsis; confidence=weak
Arabidopsis	`AT1G43760` (AT1G43760) DNAse I-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840968] identity=23; qcov=0.893; evalue=7.16e-13; confidence=weak
Rice	`Os06g0484800` - identity=23.2; qcov=0.91; evalue=1.14e-12; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025629

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057811408.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057811408.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811408.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811408.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057811408.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:20176929`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	18	A5,B106,B114,B129,B30,B38,B39,B4,B45,B82,C17,C32,C36,C40,C68,C73,C79,D6
`Chr5:20176955`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	A3,A9,B117,B136,B14,B72,C4,C77
`Chr5:20176994`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B92,B97,C87
`Chr5:20177038`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	28	A21,A24,A3,A8,B115,B119,B137,B17,B22,B25,B27,B44,B71,B74,B8,B85,B90,C20,C25,C31,C45,C49,C57,C58,C70,C72,C86,D9
`Chr5:20177055`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	70	A14,A20,A21,A23,A9,B11,B110,B113,B12,B121,B127,B13,B133,B139,B14,B31,B33,B35,B37,B38,B4,B40,B41,B42,B43,B46,B48,B51,B52,B58,B59,B6,B63,B67,B69,B75,B77,B78,B79,B8,B88,B89,B91,B94,B95,B97,B98,C10,C11,C16,C27,C32,C36,C4,C41,C43,C44,C45,C47,C54,C55,C59,C63,C66,C69,C74,C76,C8,C81,D11
`Chr5:20177070`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C32
`Chr5:20177132`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B138,B140,B24,C85
`Chr5:20177135`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	122	A11,A15,A21,A24,A25,A3,A4,A6,A8,A9,B1,B100,B102,B106,B107,B109,B11,B110,B111,B112,B114,B115,B117,B118,B12,B120,B121,B124,B127,B128,B129,B130,B132,B134,B135,B138,B139,B15,B16,B17,B19,B20,B21,B22,B25,B26,B36,B39,B41,B47,B49,B5,B54,B55,B60,B61,B66,B67,B70,B71,B73,B74,B75,B78,B8,B80,B81,B82,B86,B89,B9,B90,B91,B93,C1,C10,C13,C17,C18,C20,C22,C23,C24,C25,C28,C3,C30,C31,C34,C35,C39,C40,C41,C42,C45,C46,C49,C5,C50,C51,C57,C58,C59,C60,C61,C7,C71,C72,C74,C75,C76,C81,C82,C83,C84,C86,D11,D2,D4,D6,D7,D9
`Chr5:20177137`	`GCT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	130	A11,A15,A21,A24,A25,A3,A4,A6,A8,A9,B1,B100,B102,B106,B107,B109,B11,B110,B111,B112,B114,B115,B117,B118,B12,B120,B121,B124,B126,B127,B128,B129,B130,B131,B132,B134,B135,B137,B138,B139,B15,B16,B17,B19,B20,B21,B22,B25,B26,B36,B38,B39,B41,B47,B49,B5,B54,B55,B60,B61,B65,B66,B67,B70,B71,B73,B74,B75,B78,B8,B80,B81,B82,B83,B85,B86,B89,B9,B90,B91,B93,C1,C10,C13,C17,C18,C20,C22,C23,C24,C25,C28,C3,C30,C31,C34,C35,C39,C40,C41,C42,C45,C46,C49,C5,C50,C51,C57,C58,C59,C60,C61,C68,C7,C71,C72,C74,C75,C76,C81,C82,C83,C84,C86,D11,D2,D4,D6,D7,D9
`Chr5:20177140`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C64,C66
`Chr5:20177165`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	C32,C68,C79
`Chr5:20177165`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C32,C68,C79

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955425.1
ATGACGGAGTTCAATCCTTCGATTTGTAACTCTTGGTGGGGAAAATATAATTTTGGCTTTGCTGTTAGAAACTCTGAAGGAAGGTCAGGGGGTTTGGTTTGTGTGTGGAATAAGGAGGTCTTCCAAGTTTCCAGCAAGTGGGAGATCAATGGGGTGGTTATTGTGAATGTGAAGTGGATTAAAGAAGATATTGGATGTTGTTTGATCAATGTTTACGCACCTGCTGGTGCGGGGGAGAAAGCTATTCTCTGGGATCTTAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025629
ATGACGGAGTTCAATCCTTCGATTTGTAACTCTTGGTGGGGAAAATATAATTTTGGCTTTGCTGTTAGAAACTCTGAAGGAAGGTCAGGGGGTTTGGTTTGTGTGTGGAATAAGGAGGTCTTCCAAGTTTCCAGCAAGTGGGAGATCAATGGGGTGGTTATTGTGAATGTGAAGTGGATTAAAGAAGATATTGGATGTTGTTTGATCAATGTTTACGCACCTGCTGGTGCGGGGGAGAAAGCTATTCTCTGGGATCTTAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811408.1
MTEFNPSICNSWWGKYNFGFAVRNSEGRSGGLVCVWNKEVFQVSSKWEINGVVIVNVKWIKEDIGCCLINVYAPAGAGEKAILWDLIKTIVEQNEDRSVCVMGDFNAVQKREERAGNGDSFGAAEARNFDRFICDSGLSEIRSQGRKFTWYKPNGKCKKDWGPRPFRFLNVWMSHPEFEQKVKKVWTENRPTGWRCFVVSEKLKKLKTELKVWNNSIFGNIDERIKDLKAELLSLDQKDERNEMGESENIRRNEIQANLT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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