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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001963`

染色体: Chr05 坐标: 20192978-20194451 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001963`
名称	SmilChr05G001963
描述	B-box zinc finger protein 21
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	20192978 - 20194451 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986616`
GeneID	`130986616`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986616`
原始查询	`SmilChr05G001963`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	B-box zinc finger protein 21
产物	B-box zinc finger protein 21
Arabidopsis	`AT1G75540` (BBX21) salt tolerance homolog2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843890] identity=42.9; qcov=1.16; evalue=2.9e-81; confidence=medium
Rice	`Os04g0540200` (OsBBX13) - identity=55.1; qcov=0.622; evalue=1.74e-58; confidence=high
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0008270 (zinc ion binding); GO:0009640 (photomorphogenesis)
KEGG	-
Pfam	PF00643 (zf-B_box)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986616

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057766056.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766056.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766056.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057766056.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057766056.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:20193278`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,A24,C14
`Chr5:20193332`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C45,C61
`Chr5:20193566`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B20,B49,C58
`Chr5:20193669`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B57,C24,C32,C68
`Chr5:20194040`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C79
`Chr5:20194221`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	10	B102,B104,B107,B45,B62,B63,B79,C31,C34,C8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766056.1

286 aa

143

286

zf-B_box

PF00643 zf-B_box 3-46 aa PF00643 zf-B_box 56-92 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766056.1`	Pfam	`PF00643`	zf-B_box	Domain	3	46	5e-12	46.5	B-box zinc finger
`XP_057766056.1`	Pfam	`PF00643`	zf-B_box	Domain	56	92	5e-12	46.5	B-box zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910073.1
TGACTATAACACACAAGCGTGTGTAAACACATGTATGTACATGGCATGATTTGCAGTGATAGATTAGTAGGAATGGGTGAATATATAAAATAAAATAAAGCCATCACTTCACTTGCCTTCTCTCTTTCTTTTATCAACGCCCCCTACGCCCCCACCCCACCTAATTCCCCTCTTCATTTCTCTCCATCATCAACAACAAATGAAGATCCTCTGCGACGTTTGCGACAAAGGCGAGGCGGCCTTCTACTGCACCGCCGACG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986616
ATGAAGATCCTCTGCGACGTTTGCGACAAAGGCGAGGCGGCCTTCTACTGCACCGCCGACGAGGCGTCCCTATGCGCCGCCTGCGACCACCGTGTCCACCACGCCAACAAGCTCGCCGGCAAACACCAGCGCTTCTCCCTCCTCCACCCCTCCCCCAAACACACCCCCCTCTGCGACATCTGCCAGGAGAGAGGCGCGTTTTTATTTTGCCAGGAAGATAGAGCGATTTTGTGCAGGGAATGCGACATTCCAATCCACAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766056.1
MKILCDVCDKGEAAFYCTADEASLCAACDHRVHHANKLAGKHQRFSLLHPSPKHTPLCDICQERGAFLFCQEDRAILCRECDIPIHKANQHTQKHSRFLLTGVRLSASPALYSESPAAPATCTPPPAKGTTAQDHKSTSNLHFSTSSISEYLIETLPGWHVEDLLDSSSPSPSAFCKSADSDLVLPFWEGDLHSNSINSSGFPTENMGFWVPQVQVHQNQSQSFLFNNDSVGFGLGNANGRRDQFKEFSTNSIRSTRKRS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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